init.d

Debian 6, c'est pas tout jeune, mais ça doit fonctionner comme ça :
Imaginons que ton daemon est le script titi.php qui se trouve dans /home/toto, tu vas devoir créer un petit fichier php nommé toto.php pour gérer le lancement et l'arrêt (tu peux tout mettre dans le même script php, mais bon, pourquoi faire bordélique...)
Tu crées un fichier dans /etc/init.d/toto.sh

#! /bin/sh
set -e
PATH=/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/home/toto
DESC="toto daemon"
NAME=toto
DAEMON=/home/toto/$NAME
PIDFILE=/var/run/$NAME.pid
SCRIPTNAME=/etc/init.d/$NAME
case "1ドル" in
 start)
 echo -n "Starting $DESC: $NAME"
 php /home/toto/toto.php start
 echo "."
 ;;
 stop)
 echo -n "Stopping $DESC: $NAME"
 php /home/toto/toto.php stop
 echo "."
 ;;
 restart|force-reload)
 echo -n "Restarting $DESC: $NAME"
 php /home/toto/toto.php restart
 sleep 1
 echo "."
 ;;
 *)
 echo "Usage: $SCRIPTNAME {start|stop|restart|force-reload}" >&2
 exit 1
 ;;
esac
exit 0

Donc dans toto.php, on a :

<?php
chdir("/home/toto");
$ordre = $argv[1];
$fait = "N";
if ($ordre == "") $ordre = "START";
if (strtoupper($ordre) == "START") {
 echo "\r\nDemarrage du daemon titi.\r\n";
 system("php titi.php < /dev/null > /dev/null 2> /dev/null &");
 $fait = "O";
}
if (strtoupper($ordre) == "STOP") {
 echo "\r\nArret du daemon titi.\r\n";
 // Là à toi de programmer un truc pour que toto.php sache qu'il doive s'arreter 
 $fait = "O";
}
if (strtoupper($ordre) == "RESTART") {
 echo "\r\nRedemarrage du daemon titi.\r\n";
 // Là à toi de programmer un truc pour que toto.php sache qu'il doive s'arreter 
 // puis
 system("php titi.php < /dev/null > /dev/null 2> /dev/null &");
 $fait = "O";
}
if ($fait == "N") {
 // affiche l'aide
 echo "\r\nTITI deamon\r\n\r\n";
 echo "commandes :\r\n";
 echo " start : demarre le serveur mail\r\n";
 echo " stop : arrete le serveur mail\r\n";
 echo " restart : arrete puis redemarre le serveur mail\r\n";
 echo " help : cette page d'aide\r\n\r\n";
}
?>

Comme dit dans le code. c'est à toi de voir comme informer titi qu'il doit cesser. Ca peut être par plein de moyens (fichier scruté, telnet, ...).
Je n'ai pas mis l'option force-reload, tu sauras bien le faire si nécessaire.

Pour qu'il se lance au (re)démarrage de la machine, faut créer un lien symbolique du fichier sh dans /etc/rc2.d :
ln -s /etc/init.d/toto.sh /etc/rc2.d/S99toto

Le S99, c'est pour "Start", et en dernier, ce qui généralement est ok, sauf si tu as besoin qu'il se lance avant d'autres deamons.