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AMED: 国立研究開発法人日本医療研究開発機構

健康・医療研究開発データ統合利活用プラットフォーム事業 AMEDデータ利活用プラットフォーム(CANNDs) 想定活用事例


想定活用事例

AMEDデータ利活用プラットフォームを介して利用できるデータの想定活用事例をまとめています。

CASE 01 製薬企業における創薬プロジェクトの優先順位付け

AMEDデータ利活用プラットフォームの利用申請でアクセス可能な約2万件について、標的生体分子の変異情報と疾患との関連を中心に確認を進めた結果、標的酵素Zの変異と疾患Aとの関連が見出された。…

PDF版の想定活用事例はこちら(454KB)

CASE 02 日本人由来がん細胞株データからの生殖系列多型の除去

AMEDデータ利活用プラットフォームの利用申請でアクセス可能な約2万件について、日本人由来がん細胞株の全ゲノムデータからGermline由来のSNPs、SVsの除去を目的に本プラットフォームのゲノムデータを取得。…


【CANNDs想定活用事例】1日本人由来がん細胞株データからの生殖系列多型の除去

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CASE 03 小児慢性疾患の新たな疾患感受性遺伝子及び 日本人特異的バリアントの発見

ある小児慢性疾患Xの日本人患者群及び非患者群を対象とした既存のSNPアレイデータに対して、AMEDデータ利活用プラットフォームが提供している大規模日本人参照パネルを用いた遺伝型インピュテーションにより…


【CANNDs想定活用事例】2小児慢性疾患の新たな疾患感受性遺伝子および日本人特異的バリアントの発見

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CASE 04 未知構造バリアントを探すプログラム開発


【CANNDs想定活用事例】3未知構造バリアントを探すプログラム開発

CASE 05 疾患原因に迫るバイオバンク利用への窓口


【CANNDs想定活用事例】4疾患原因に迫るバイオバンク利用への窓口

CASE 06 【CANNDs利用方法解説】Docker上でのJupyter Notebookの利用


【CANNDs利用方法解説】5Docker上でのJupyter Notebookの利用

最終更新日 令和7年6月26日

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