岡本 有司

論文

• Supervised Graph Contrastive Learning for Gene Regulatory Network

  Sho Oshima, Yuji Okamoto, Taisei Tosaki, Ryosuke Kojima

  Accepted in ICML 2026 (arXiv:2505.17786) 2026年7月 査読有り筆頭著者責任著者
• A deep state-space analysis framework for cancer patient latent state estimation and classification from EHR time-series data

  Yuji Okamoto, Aya Nakamura, Ryosuke Kojima, Eiichiro Uchino, Yohei Mineharu, Yohei Harada, Mayumi Kamada, Minoru Sakuragi, Manabu Muto, Motoko Yanagita …

  PLOS One 21(1) e0341003-e0341003 2026年1月30日 査読有り筆頭著者
• Transformers for Time-Series Forecasting: A Comprehensive Survey through 2024

  Yuji Okamoto

  NOLTA E17-N(1) 2026年1月 査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
• Improving ADME Prediction with Multitask Graph Neural Networks and Assessing Explainability in Lead Optimization

  Shoma Ito, Takuto Koyama, Shigeyuki Matsumoto, Ryosuke Kojima, Yuji Okamoto, Masataka Kuroda, Hitoshi Kawashima, Reiko Watanabe, Tomoki Yonezawa, Takaaki Sumiyoshi …

  Journal of Chemical Information and Modeling 2025年10月22日 査読有り
• Learning the Simplest Neural ODE

  Yuji Okamoto, Tomoya Takeuchi, Yusuke Sakemi

  2025 SICE Festival with Annual Conference (SICE FES) 575-578 2025年9月9日 査読有り筆頭著者最終著者責任著者
• Harnessing Nonidealities in Analog In‐Memory Computing Circuits: A Physical Modeling Approach for Neuromorphic Systems

  Yusuke Sakemi, Yuji Okamoto, Takashi Morie, Sou Nobukawa, Takeo Hosomi, Kazuyuki Aihara

  Advanced Intelligent Systems 2025年8月18日 査読有り
• Quantitative Assessment of Microsurgical Skill in Intrascleral Fixation Surgery Using Wearable Strain Sensors: A Pilot Study

  Masahiro Akada, Hitoshi Tabuchi, Yuji Okamoto, Mao Tanabe, Ryo Nishikawa, Shin Yamane, Akitaka Tsujikawa, Yasushi Okuno

  Translational Vision Science & Technology 14(7) 7-7 2025年7月16日 査読有り
• ノックダウン細胞株の遺伝子制御ネットワークを用いたグラフニューラルネットワークの転移学習と薬剤応答推定

  大島 将, 岡本 有司, 戸﨑 泰誠, 奥野 恭史

  人工知能学会全国大会論文集 (3H5-OS-10c-04) 2025年7月 査読有り責任著者
• 区分線形埋め込みを用いたDecoder型 Tabualr Transformerモデルの検討

  戸﨑 泰誠, 荒武 奈々瑛, 岡本 有司, 内野 詠一郎, 小島 諒介, 奥野 恭史

  人工知能学会全国大会論文集 (2Win5-05) 2025年7月 査読有り責任著者
• Tabular Transformerのラベル名と値に対して独立な新しいMasked Prediction手法の提案と検討

  荒武 奈々瑛, 戸﨑 泰誠, 岡本 有司, 内野 詠一郎, 小島 諒介, 奥野 恭史

  人工知能学会全国大会論文集 (2Win5-06) 2025年7月 査読有り責任著者
• Out-of-distribution reject option method for dataset shift problem in early disease onset prediction

  Taisei Tosaki, Eiichiro Uchino, Ryosuke Kojima, Yohei Mineharu, Yuji Okamoto, Mikio Arita, Nobuyuki Miyai, Yoshinori Tamada, Tatsuya Mikami, Koichi Murashita …

  Scientific Reports 15(1) 2025年6月2日 査読有り
• ノックダウン細胞株の遺伝子制御ネットワークを用いたグラフニューラルネットワークの転移学習と薬剤応答推定

  大島 将, 岡本 有司, 戸﨑 泰誠, 奥野 恭史

  2025年度人工知能学会全国大会 2025年5月29日
• 区分線形埋め込みを用いた Decoder型 Tabular Transformerモデルの検討

  戸﨑 泰誠, 荒武 奈々瑛, 岡本 有司, 内野 詠一郎, 小島 諒介, 奥野 恭史

  2025年度人工知能学会全国大会 2025年5月28日
• Tabular Transformerのラベル名と値に対して独立な\\新しいMasked Prediction手法の提案と検討

  荒武 奈々瑛, 戸﨑 泰誠, 岡本 有司, 内野 詠一郎, 小島 諒介, 奥野 恭史

  2025年度人工知能学会全国大会 2025年5月28日
• Learning Deep Dissipative Dynamics

  Yuji Okamoto, Ryosuke Kojima

  Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence 39(18) 19749-19757 2025年4月11日 査読有り筆頭著者最終著者責任著者
• Investigating T‐Cell Receptor Dynamics Under In Vitro Antibody‐Based Stimulation Using Imaging Flow Cytometry

  Akihiro Isozaki, Kazuma Kita, Natsumi Tiffany Ishii, Yuma Oka, Maik Herbig, Mai Yamagishi, Tsubasa Wakamiya, Taketo Araki, Hiroki Matsumura, Jeffrey Harmon …

  Cytometry Part A 107(2) 88-97 2025年2月21日 査読有り
• Predicting mortality dynamics in cancer patients: A machine learning approach to pre-death events.

  Tatsuki Yamamoto, Minoru Sakuragi, Yuzuha Tuji, Yuji Okamoto, Eiichiro Uchino, Motoko Yanagita, Manabu Muto, Mayumi Kamada, Yasushi Okuno

  PloS one 20(9) e0331650 2025年 査読有り
• グラフ間距離に基づく遺伝子制御ネットワークの重要遺伝子抽出法の提案

  大島 将, 岡本 有司, 原田 陽平, 鎌田 真由美, 奥野 恭史

  2024年度人工知能学会全国大会(第38回) 2024年5月31日
• 遺伝性不整脈疾患における遺伝子変異特徴抽出手法の比較

  三谷 孟司, 岡本 有司, 糀谷 泰彦, 相澤 卓範, 牧山 武, 大野 聖子, 堀江 稔, 奥野 恭史

  2024年度 人工知能学会全国大会(第38回) 2024年5月28日
• Early dynamics of chronic myeloid leukemia on nilotinib predicts deep molecular response

  Yuji Okamoto, Mitsuhito Hirano, Kai Morino, Masashi K. Kajita, Shinji Nakaoka, Mayuko Tsuda, Kei-ji Sugimoto, Shigehisa Tamaki, Junichi Hisatake, Hisayuki Yokoyama …

  npj Systems Biology and Applications 8(1) 2022年10月13日 査読有り筆頭著者