岡本 有司

基本情報

所属

特定国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 研究員

京都大学 大学院医学研究科 客員研究員

東京大学 IRCN 協力研究員

慶應義塾大学 理工学部 物理情報工学科 訪問助教

学位

博士(工学)(2017年3月 東京工業大学)

修士(工学)(2014年3月 東京工業大学)

研究者番号

40993051

ORCID iD

https://orcid.org/0000-0003-0024-549X

J-GLOBAL ID

202301008909145677

researchmap会員ID

R000056959

主要な研究キーワード

• 制御理論と深層学習の融合

主要な研究分野

• 情報通信 / ロボティクス、知能機械システム / 制御理論
• 情報通信 / 情報学基礎論 / 深層学習

主要な経歴

• 2021年4月 - 現在

  東京大学, ニューロインテリジェンス国際研究機構, 協力研究員

主要な学歴

• 2014年4月 - 2017年3月

  東京工業大学, 大学院情報理工学研究科, 情報環境学専攻

主要な委員歴

• 2024年1月 - 現在

  計測自動制御学会 制御部門 プラントモデリング部会, 幹事

受賞

• 2024年7月

  全国大会優秀賞, グラフ間距離に基づく遺伝子制御ネットワークの重要遺伝子抽出法の提案, 人工知能学会

  大島将, 岡本有司, 原田陽平, 鎌田真由美, 奥野恭史
• 2023年10月

  Excellent Poster Award 2023, Elucidation of Mortality Triggers Using Temporal Predictive Models, Chemo-Bio Informatics Society

  Tatsuki YAMAMOTO, Yuzuha TSUJI, Minoru SAKURAGI, Yuji OKAMOTO, Mayumi KAMADA, Yasushi OKUNO
• 2022年7月

  奨励賞, 時系列モデルを用いたニボルマブ投与がん患者の潜在状態推定, 日本メディカルAI学会

  中村綾, 小島諒介, 岡本有司, 鎌田真由美, 奥野恭史
• 2016年11月

  優秀発表賞, ポジティブ2次システムのL1ゲインの解析, 第59回自動制御連合講演会

  岡本有司, 井村順一, 岡田眞里子
• 2016年5月

  奨励賞, ポジティブ2次システムオブザーバーの設計, システム制御情報学会

  岡本有司, 井村順一, 岡田眞里子

主要な論文

• Supervised Graph Contrastive Learning for Gene Regulatory Network

  Sho Oshima, Yuji Okamoto, Taisei Tosaki, Ryosuke Kojima

  Accepted in ICML 2026 (arXiv:2505.17786) 2026年7月 査読有り筆頭著者責任著者
• Learning Deep Dissipative Dynamics

  Yuji Okamoto, Ryosuke Kojima

  Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence 39(18) 19749-19757 2025年4月11日 査読有り筆頭著者最終著者責任著者
• Learning Deep Input-Output Stable Dynamics

  Kojima, Ryosuke, Okamoto, Yuji

  Advances in Neural Information Processing Systems 35 8187-8198 2022年 査読有り筆頭著者最終著者責任著者

MISC

• A Nationwide Japanese Medical Claims Foundation Model: Balancing Model Scaling and Task-Specific Computational Efficiency.

  Nanae Aratake, Taisei Tosaki, Yuji Okamoto, Eiichiro Uchino, Masaki Nakamura, Nobutomo Matsui, Akiko Hatakama, Yasushi Okuno

  CoRR abs/2604.22348 2026年4月
• 時系列AI研究の世界的な動き

  岡本有司

  計測と制御 65(3) 2026年
• 時系列基盤モデル入門

  岡本有司

  計測と制御 65(3) 2026年
• DNB 理論とその応用

  Oku, Makito, Yamashita, Hiroshi, Okamoto, Yuji, Aihara, Kazuyuki

  生体の科学 74(2) 96-101 2023年 招待有り
• 医療リソースシミュレーション

  岡本有司

  Precision Medicine, 特集:新型コロナウイルスとシミュレーション 2023年 招待有り筆頭著者

書籍等出版物

• 大規模データ・AIが切り拓く脳神経科学 : 見えてきた行動、感情、記憶の神経基盤と精神・神経疾患の生物学的なサブタイプ

  笠井, 清登, 榎本, 和生 (担当:分担執筆, 範囲:第3章3節.非線形科学の脳神経解析への応用【信川 創,平野羊嗣,田村俊介,岡本有司,水口成寛,牛場潤一,岩間清太朗,合原一幸】)

  羊土社 2024年5月 (ISBN: 9784758104180)

主要な講演・口頭発表等

• 時系列TRANSFORMERの野望 - 深層学習を使用した時系列システムの変遷のまとめ2024年5月まで –

  岡本 有司

  ネオMEセミナー 2024年6月10日 招待有り
• 入出力安定な深層ダイナミクスの学習 (NeurIPS2022から)

  岡本有司

  第67回 システム制御情報学会研究発表講演会 研究講演会 2023年5月17日 招待有り

担当経験のある科目(授業)

• 2025年10月 - 現在

  ビッグデータ医科学総論 (京都大学)
• 2021年4月 - 現在

  ビックデータ医科学特論 (京都大学)
• 2021年4月 - 現在

  基礎バイオインフォマティクス (京都大学)

主要な所属学協会

• 2024年3月 - 現在

  人工知能学会
• 2025年2月 - 2026年2月

  AAAI

共同研究・競争的資金等の研究課題

• Decoder-only Transformerを用いた半導体レイアウトのSupervised Finetuning

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 2026年4月 - 2029年3月

  岡本 有司
• アナログ回路の非線形特性を活用した脳型インメモリ計算の開拓

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 2025年2月 - 2028年3月

  酒見 悠介
• バイオ超越への応用を目指した大規模脳波データに基づくヒトの脳機能創発機構の解明

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 学術変革領域研究(A) 2025年4月 - 2027年3月

  信川 創
• 「富岳」で目指すシミュレーション・AI駆動型次世代医療・創薬

  理化学研究所 「富岳」成果創出加速プログラム 2024年4月 - 2026年3月
• 12誘導心電図からの心内心電図情報予測に基づく不整脈疾患精密診断プログラムの開発研究

  国立研究開発法人日本医療研究開発機構 官民による若手研究者発掘支援事業 2023年度 / 令和年5度 社会実装目的型の医療機器創出支援プロジェクト(医療機器開発研究) 2023年6月 - 2025年3月

  糀谷泰彦
• 複雑臓器制御系の数理的包括理解と超早期精密医療への挑戦

  科学技術振興機構 戦略的な研究開発の推進 ムーンショット型研究開発事業 2020年 - 2025年

  合原 一幸

産業財産権

• 特許第7545202号 細胞解析方法、細胞解析装置、細胞解析システム、及び細胞解析プログラム

  今久保 桃子, 陸 建銀, 白井 健太郎, 勝俣 恵理, 岡本 有司
• 特許第7475848号 細胞解析方法、細胞解析装置、細胞解析システム、及び細胞解析プログラム、並びに訓練された人工知能アルゴリズムの生成方法、生成装置、及び生成プログラム

  白井 健太郎, 勝俣 恵理, 岡本 有司, 今久保 桃子, 陸 建銀
• 特許US12020492B2 CELL ANALYSIS METHOD, CELL ANALYSIS DEVICE, AND CELL ANALYSIS SYSTEM

  Momoko Imakubo, Jianyin Lu, Kentaro Shirai, Eri Katsumata, Yuji Okamoto
• 特願US-20210164886-A1 CELL ANALYSIS METHOD, CELL ANALYSIS DEVICE, CELL ANALYSIS SYSTEM, CELL ANALYSIS PROGRAM, AND TRAINED ARTIFICIAL INTELLIGENCE ALGORITHM GENERATION METHOD

  Kentaro Shirai, Eri Katsumata, Yuji Okamoto, Momoko Imakubo, Jianyin Lu

学術貢献活動

• Reviewer, Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS) 2026

  査読

  Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS) 2026 2026年5月 - 2026年9月
• 人工知能学会 全国大会2026、オーガナイザー

  企画立案・運営等

  2026年6月
• (Silver) Reviewer, International Conference on Machine Learning (ICML) 2026

  査読

  2026年2月 - 2026年3月
• 計測と制御 査読委員

  査読

  計測自動制御学会 2024年4月 - 2026年3月
• 計測と制御 65(3) 特集「時系列AIの最前線」企画担当

  企画立案・運営等

  計測自動制御学会 会誌「計測と制御」 2026年3月
• Reviewer, 63rd Design Automation Conference (DAC 2026)

  査読

  Design Automation Conference 2025年12月 - 2026年1月
• The International Conference on Learning Representations (ICLR), 査読委員

  査読

  International Conference on Learning Representations 2025年10月 - 2025年11月
• Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA), 査読委員

  査読

  IEICE 2025年7月
• SICE FES, 査読委員

  査読

  計測自動制御学会 2024年4月 - 2025年6月
• 人工知能学会 全国大会2025、オーガナイザー

  企画立案・運営等

  人工知能学会 2025年6月
• IEEE Conference on Decision and Control (CDC), 査読委員

  査読

  IEEE 2025年4月
• SICE International Symposium on Control Systems 査読委員

  査読

  計測自動制御学会 2023年12月 - 2025年3月

社会貢献活動

• 転移学習輪読会

  出演, 司会, 企画, 運営参加・支援

  数理統計学習関連勉強会(connpass) 転移学習輪読会 2025年3月10日 - 2025年11月18日
• AIチッカイギ 第2弾

  出演

  デジタル庁 AIチッカイギ第2弾! ガバメントAIの整備を目前にしたデジタル行政・未来予想図 〜最先端AI研究者とともに、AIを組み込む行政事業の在り方を考える〜 2025年10月16日 - 2025年10月16日
• 強化学習読書会

  出演, 司会, 運営参加・支援

  数理統計学習関連勉強会(connpass) 強化学習読書会 2020年11月1日 - 2021年4月10日
• 大学、企業の立場から中長期研究インターンシップに期待すること

  パネリスト

  一般社団法人産学協働イノベーション人材育成協議会 産学協働イノベーション人材育成シンポジウム 2016 〈新しいインターンシップ〉のかたちII 2016年10月26日 - 2016年10月26日