矢田 哲士

MISC

• Oncofetal geneの体系的な探索

  原 惇史, 水谷 玲菜, 秋光 信佳, 矢田 哲士

  生命科学系学会合同年次大会 2017年度 [1P-0751] 2017年12月
• A new computational method to predict transcriptional activity of a DNA sequence from diverse datasets of massively parallel reporter assays

  Ying Liu, Takuma Irie, Tetsushi Yada, Yutaka Suzuki

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH 45(13) 2017年7月
• Estimating optimal sparseness of developmental gene networks using a semi-quantitative model

  Natsuhiro Ichinose, Tetsushi Yada, Hiroshi Wada

  PLOS ONE 12(4) 2017年4月
• 次世代型シークエンサーを用いた変異プロモーターの網羅的解析

  入江拓磨, 劉瑩, 榊原雄太, 門城拓, 関真秀, 菅野純夫, 矢田哲士, 鈴木穣

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th ROMBUNNO.1P‐0875 (WEB ONLY) 2016年
• 変異導入プロモーターの転写活性データを用いて転写制御コードを解読する

  劉 瑩, 入江 拓磨, 門城 拓, 矢田 哲士, 鈴木 穣

  日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 88回・38回 [4T14L-04(3P0704)] 2015年12月
• 次世代型シークエンサーを用いた変異プロモーターの網羅的解析

  入江拓磨, 劉瑩, 門城拓, 関真秀, 榊原雄太, 菅野純夫, 矢田哲士, 鈴木穣

  日本生化学会大会(Web) 88th 3P0842 (WEB ONLY) 2015年
• Long Noncoding RNA NEAT1-Dependent SFPQ Relocation from Promoter Region to Paraspeckle Mediates IL8 Expression upon Immune Stimuli (vol 53, pg 393, 2014)

  Katsutoshi Imamura, Naoto Imamachi, Gen Akizuki, Michiko Kumakura, Atsushi Kawaguchi, Kyosuke Nagata, Akihisa Kato, Yasushi Kawaguchi, Hiroki Sato, Misako Yoneda …

  MOLECULAR CELL 54(6) 1055-1055 2014年6月
• 次世代シークエンサーによる変異プロモーターの網羅的解析

  入江拓磨, 門城拓, 劉エイ, 関真秀, 菅野純夫, 矢田哲士, 鈴木穣

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 37th 2P-0985 (WEB ONLY) 2014年
• miRNA-target prediction based on transcriptional regulation

  Toyofumi Fujiwara, Tetsushi Yada

  BMC GENOMICS 14 2013年2月
• Identification of hundreds of novel UPF1 target transcripts by direct determination of whole transcriptome stability

  Hidenori Tani, Naoto Imamachi, Kazi Abdus Salam, Rena Mizutani, Kenichi Ijiri, Takuma Irie, Tetsushi Yada, Yutaka Suzuki, Nobuyoshi Akimitsu

  RNA BIOLOGY 9(11) 1370-1379 2012年11月
• 超並列シークエンサーを用いたヒト変異プロモーターのハイスループット解析

  入江拓磨, 関真秀, 菅野純夫, 矢田哲士

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 3P-0753 (WEB ONLY) 2012年
• Large-scale motif discovery using DNA Gray code and equiprobable oligomers

  Natsuhiro Ichinose, Tetsushi Yada, Osamu Gotoh

  BIOINFORMATICS 28(1) 25-31 2012年1月
• Predicting promoter activities of primary human DNA sequences

  Takuma Irie, Sung-Joon Park, Riu Yamashita, Masahide Seki, Tetsushi Yada, Sumio Sugano, Kenta Nakai, Yutaka Suzuki

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH 39(11) 2011年6月
• Linear regression models predicting strength of transcriptional activity of promoters.

  Yada T, Yoshida K, Morita M, Taniguchi T, Irie T, Suzuki Y

  Genome informatics. International Conference on Genome Informatics 25(1) 53-60 2011年
• Linear regression models predicting strength of transcriptional activity of promoters.

  25(1) 53-60 2011年