SCP財団

Site-45は

「サイト-45は」ですね。

located off the coast of Western Australia under the Indian Ocean
インド洋沿岸の西オーストラリア沿岸に位置する

• "under"は「海中」のような意味ではないでしょうか。
• off the coastは「沿岸」というよりは「沖合」でしょう。

翻訳案: インド洋海中の西オーストラリア沖に位置する

Here, research and temporary containment of anomalous objects are conducted under guard and away from a civilian populace.
ここではアノマリーの研究や一時的な収容は民間人から保護され、隔離されて行われています。

私の主観を含みますが、この箇所だけ見ると「活動が民間人から保護・隔離されている」ことがサイト-45の特色であるかのように見えます。
翻訳案: ここではアノマリーの研究や一時的な収容が民間人から保護・隔離された状態で行われています。

Site-45 also serves as a staging point for MTF operations within the Pacific and Indian Oceans.
また、サイト-45は太平洋及びインド洋での機動部隊の足場としても機能しています。

• operationsが訳抜けです。
• Wikipediaの"staging area"の記事ならびにThe Free Dictionaryのstaging pointの項目から、staging point はstaging areaとも呼ばれ、"A place where troops or equipment in transit are assembled and processed (as before a military operation)."という意味があることが分かります (要するに「作戦実行前に集まって準備する場所」のような意味です)。私でしたら意味の分かりやすさを考慮して「中継基地」と訳します。

翻訳案: また、サイト-45は太平洋及びインド洋における機動部隊活動の中継基地としても機能しています。

Located approximately 0.5 km below Forest Park, northwest of Portland, Oregon,
オレゴン州北西に位置するポートランド森林公園の約0.5 kmにある

belowが訳抜けです。
翻訳案: オレゴン州北西に位置するポートランド森林公園の地下約0.5 kmにある

minor anomalous items
低脅威のanomalousアイテム

high value anomalous items
高価値anomalousアイテム

Anomalous Itemは通常最初の"A"を大文字で表記します。小文字で書かれているということはおそらく単に「異常物品」という意味ではないかと思われます (「あまり役に立ちそうにないアイテム」と明記されているものなのに「高価値」というのも矛盾しているように感じられます)。

施設リスト中の サイト76に関する説明で

この施設に収容されている対象の例はSCP-140、SCP-720、SCP-1883です。

とありますが、SCP‐720はサイト77に保管されています。