Si tu cherches qq chose "sequence-oriented", tu dois avoir des tonnes de dépendances vers des bases de données. Pour cela, EMBnet a fait un LiveDVD il y a quelque temps, tu dois pouvoir le trouver ds google avec les mots clés appropriés. Il contient en principe des DB (SwissProt entre autre, ainsi que des softs "classiques"), probablemnet EMBOSS/JEMBOSS. Si tu veux des infos, je suis en connexion avec "le milieu" et je peux aller à la pêche (aux moules).
Si tu cherche qqchose "stat-oriented" (analyse de chip par ex), je ne sais pas.
Mais si tu cherches qq chose "structure-oriented" (tinker ou gromacs en back-end, CHARMM et Amber n'etant pas distribuables), avec VMD/Molmol/Chimera/Pymol et tout le toutime ca m'interesse bien de suivre ton projet. -> MP.
# liveDVD
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse au message debian orientée bioinformatique. Évalué à 1.
Si tu cherches qq chose "sequence-oriented", tu dois avoir des tonnes de dépendances vers des bases de données. Pour cela, EMBnet a fait un LiveDVD il y a quelque temps, tu dois pouvoir le trouver ds google avec les mots clés appropriés. Il contient en principe des DB (SwissProt entre autre, ainsi que des softs "classiques"), probablemnet EMBOSS/JEMBOSS. Si tu veux des infos, je suis en connexion avec "le milieu" et je peux aller à la pêche (aux moules).
Si tu cherche qqchose "stat-oriented" (analyse de chip par ex), je ne sais pas.
Mais si tu cherches qq chose "structure-oriented" (tinker ou gromacs en back-end, CHARMM et Amber n'etant pas distribuables), avec VMD/Molmol/Chimera/Pymol et tout le toutime ca m'interesse bien de suivre ton projet. -> MP.
A.