鈴木慶彦 (Yoshihiko Suzuki) - マイポータル

基本情報

所属: 情報・システム研究機構特任講師; 東京大学客員研究員

研究者番号: 10991713
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-8807-2206
J-GLOBAL ID: 202201010927103474
researchmap会員ID: R000046370

経歴

2026年4月 - 現在

情報・システム研究機構, データサイエンス共同利用基盤施設バイオ生成AI研究開発センター, 特任講師
2023年1月 - 2026年3月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻, 特任助教
2022年4月 - 2022年12月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻, 特任研究員
2020年7月 - 2022年3月

沖縄科学技術大学院大学, 生態進化ゲノミクスアルゴリズムユニット, 博士研究員
2020年4月 - 2020年6月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻, 特任研究員
2018年4月 - 2020年3月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員 (DC2)
2017年9月 - 2018年3月

マックスプランク分子細胞生物学遺伝学研究所, 客員学生
2015年4月 - 2018年3月

東京大学大学院博士課程教育リーディングプログラム, 社会構想マネジメントを先導するグローバルリーダー養成プログラム (GSDM)

学歴

2017年4月 - 2020年3月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, メディカル情報生命専攻博士後期課程
2015年4月 - 2017年3月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, メディカル情報生命専攻修士課程
2011年4月 - 2015年3月

東京大学, 理学部, 生物情報科学科

受賞

論文

HPRC2: A human pangenome reference with near-complete coverage of common genetic variation

Julian K. Lucas, Prajna Hebbar, Wen-Wei Liao, Juan F. Macias-Velasco, Adam M. Novak, Mobin Asri, Jennifer R. Balacco, Andrew P. Blair, Jana Ebler, Joshua M.V. Gardner …

2026年7月22日
Complete sequencing of medaka genomes reveals the architecture of centromeric satellites, giant mobile elements, and sex chromosomes

Yoshihiko Suzuki, Kazuki Ichikawa, Yusuke Inoue, Chie Owa, Haruka Kobayashi, Kenji Morikami, Ryohei Nakamura, Takafumi Ikeda, Manabu Fujie, Mayumi Kawamitsu …

Genome Research 36(8) 1696-1707 2026年7月査読有り筆頭著者
Accessing medically relevant complex regions with a pangenome graph of 20 near-complete Japanese haplotypes

Yoshihiko Suzuki, Chie Owa, Haruka Kobayashi, Ryo Nakabayashi, Brandy McNulty, Ivo Violich, Benedict Paten, Karen H. Miga, Shinichi Morishita

Nature Communications 17 2026年5月27日査読有り筆頭著者責任著者
Saturation Genome Editing Targeting KRAS Mutations in HCT 116 Colon Carcinoma Cells for Pooled SNV Functional Profiling in Diploid Cancer Model

Taiji Hamada, Seiya Yokoyama, Ryo Nakabayashi, Yoshihiko Suzuki, Shinichi Morishita, Toshiaki Akahane, Kei Matsuo, Ikumi Kitazono, Tatsuhiko Furukawa, Akihide Tanimoto

Current Issues in Molecular Biology 48(4) 341-341 2026年3月25日査読有り
Centromere methylation and genome divergence during vertebrate speciation

Shinichi Morishita, Yoshihiko Suzuki, Kazuki Ichikawa, Yusuke Inoue, Chie Owa, Haruka Kobayashi, Kenji Morikami, Ryohei Nakamura, Takafumi Ikeda, Manabu Fujie …

2025年9月23日筆頭著者
CGC1, a new reference genome for Caenorhabditis elegans

Kazuki Ichikawa, Massa J. Shoura, Karen L. Artiles, Dae-Eun Jeong, Chie Owa, Haruka Kobayashi, Yoshihiko Suzuki, Manami Kanamori, Yu Toyoshima, Yuichi Iino …

Genome Research 35(8) 1902-1918 2025年7月15日査読有り
Nearly T2T, phased genome assemblies of corals reveal haplotype diversity and the evolutionary process of gene expansion

Takeshi Takeuchi, Yoshihiko Suzuki, Eiichi Shoguchi, Manabu Fujie, Mayumi Kawamitsu, Chuya Shinzato, Noriyuki Satoh, Eugene W Myers

DNA Research 32(4) 2025年7月4日査読有り筆頭著者
A Haplotype-resolved Chromosome-scale Genome Assembly and Annotation for the Leafcutter Ant, Acromyrmex octospinosus

Gaurav Agavekar, Yoshihiko Suzuki, Miyuki Suenaga, Miguel Pacheco-Leiva, Michael Hiller, Adrián A Pinto-Tomas, Eugene Myers, Evan P Economo

Genome Biology and Evolution 2025年3月6日査読有り
JTK: targeted diploid genome assembler

Bansho Masutani, Yoshihiko Suzuki, Yuta Suzuki, Shinichi Morishita

Bioinformatics (Oxford, England) 39(7) 2023年7月1日査読有り
A high-quality, haplotype-phased genome reconstruction reveals unexpected haplotype diversity in a pearl oyster

Takeshi Takeuchi, Yoshihiko Suzuki, Shugo Watabe, Kiyohito Nagai, Tetsuji Masaoka, Manabu Fujie, Mayumi Kawamitsu, Noriyuki Satoh, Eugene W Myers

DNA Research 29(6) 2022年12月査読有り筆頭著者
Accurate k-mer Classification Using Read Profiles

Yoshihiko Suzuki, Gene Myers

22nd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2022) 242(10) 1-20 2022年9月査読有り筆頭著者
メタゲノムおよびセントロメアにおける反復配列の完全な再構成に向けて

鈴木慶彦

博士論文 2020年3月23日
Long-read metagenomic exploration of extrachromosomal mobile genetic elements in the human gut

Yoshihiko Suzuki, Suguru Nishijima, Yoshikazu Furuta, Jun Yoshimura, Wataru Suda, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Shinichi Morishita

Microbiome 7(1) 2019年12月査読有り筆頭著者

MISC

Consortium of Long Read Sequencing Database (CoLoRSdb)

Juniper Ada Lake, Consortium of Long Read Sequencing (CoLoRS)

2024年6月
ヒトゲノム完全解読の成功とその意義

鈴木慶彦, 森下真一

実験医学 40(13) 2022年8月
ロングリードメタゲノミクス

鈴木慶彦, 西嶋傑, 森下真一

ヒトマイクロバイオーム Vol. 2 37-46 2020年6月
PacBioロングリードを用いたメタゲノム解析

鈴木慶彦, 森下真一

実験医学別冊 2016年12月

講演・口頭発表等

Accessing medically relevant complex regions with a pangenome of 20 near-complete Japanese haplotypes

Yoshihiko Suzuki

HPRC Annual Meeting 2025年10月6日
メダカゲノムの完全解読が明らかにするセントロメア、性染色体、巨大トランスポゾンの進化の新知見

鈴木慶彦

日本動物学会第96回名古屋大会 2025年9月5日招待有り
The Japanese Pangenome

Yoshihiko Suzuki

International Genome Graph Symposium 2024 2024年7月2日
JTK: targeted diploid genome assembler

Yoshihiko Suzuki

第14回国際ゲノム会議 2023年10月6日
PacBio HiFi リードを用いた二倍体ゲノムアセンブリの進展

鈴木慶彦

PacBio HiFi Sequencing Experience Tour ロードショーイベント 2023年5月18日招待有り
Accurate k-mer classification using read profiles

Yoshihiko Suzuki

22nd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2022) 2022年9月
Accurate k-mer classification using read profiles

Yoshihiko Suzuki

Biodiversity Genomics 2021 2021年9月
Highly diversified metamethylome and metamobilome in human gut metagenomes

Yoshihiko Suzuki

SMRTLeiden 2017年5月
Metagenome, metamobilome and meta-methylome of human gut flora uncovered by SMRT sequencing

Yoshihiko Suzuki

Advances in Genome Biology and Technology (AGBT) General Meeting 2017年2月

担当経験のある科目(授業)

2023年11月 - 2025年12月

情報基礎実験 (東京大学理学部生物情報科学科)
2015年12月 - 2017年1月

情報基礎実験 (東京大学理学部生物情報科学科)

共同研究・競争的資金等の研究課題

ヒト二倍体ゲノム配列を高効率・高精度にハプロタイプ別アセンブリする手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2024年4月 - 2028年3月

鈴木慶彦
一分子DNAシーケンサーによる細菌叢情報の完全な再構成

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2018年4月 - 2020年3月

鈴木慶彦