山元 孝佳

基本情報

所属

東京学芸大学 教育学部 広域自然科学講座 講師

学位

博士(理学)(東京大学)

連絡先

yamagenu-gakugei.ac.jp

研究者番号

70724699

ORCID iD

https://orcid.org/0000-0001-8028-6050

J-GLOBAL ID

201701001297076989

researchmap会員ID

B000277125

外部リンク

https://embryogenesis.wixsite.com/website

研究キーワード

• シミュレーション
• 数理生物学
• モルフォゲン
• 初期発生
• 形態形成
• 分子生物学
• 発生生物学

研究分野

• ライフサイエンス / 形態、構造 /
• ライフサイエンス / 分子生物学 /
• ライフサイエンス / 発生生物学 /

主要な経歴

• 2025年4月 - 現在

  東京学芸大学, 教育学部 広域自然科学講座, 講師
• 2018年4月 - 2025年3月

  東京大学, 大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系(道上達男教授研究室), 助教

学歴

• 2009年4月 - 2013年9月

  東京大学, 大学院理学系研究科, 生物科学専攻博士課程(武田洋幸教授研究室)
• 2007年4月 - 2009年3月

  東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 生命情報専攻(岸本健雄教授研究室)
• 2003年4月 - 2007年3月

  東京工業大学, 生命理工学部, 生命科学科(岸本健雄教授研究室)

委員歴

• 2022年9月 - 現在

  Review editor "Frontiers in Amphibian and Reptile Science"
• 2022年11月 - 2024年10月

  日本動物学会関東支部, 特任委員
• 2020年9月 - 2022年3月

  日本動物学会関東支部, 特任委員
• 2021年6月

  第14回日本ツメガエル研究集会 運営委員
• 2021年3月

  日本動物学会関東支部大会 運営委員
• 2020年4月 - 2020年9月

  国際生物学オリンピック, 第31回長崎大会 作題委員
• 2018年4月 - 2019年3月

  東京大学 生命科学シンポジウム, 実行委員
• 2016年7月

  第10回日本ツメガエル研究会首都圏支部大会 運営委員
• 2013年9月 - 2014年8月

  生化学若い研究者の会, 第54回生命科学夏の学校 運営委員
• 2011年1月 - 2013年12月

  生化学若い研究者の会 キュベット委員
• 2011年4月 - 2012年3月

  東京大学グローバルCOE「生体シグナルを基盤とする統合生命学」リトリート委員

受賞

• 2025年4月

  Top Viewed Article: Ndst1, a heparan sulfate modification enzyme, regulates neuroectodermal patterning by enhancing Wnt signaling in Xenopus, Ndst1, a heparan sulfate modification enzyme, regulates neuroectodermal patterning by enhancing Wnt signaling in Xenopus, Development, Growth & Differentiation
• 2024年11月

  Poster Award, Mechanical Measurements of Single Cells in the Animal Pole of Xenopus Embryos by Atomic Force Microscopy, Asian Xenopus Conference 2024

  Miki Yamamoto, Takahiro Kotani, Yuki Miyata, Yosuke Tsuboyama, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue, Takaharu Okajima
• 2024年11月

  Poster Award, Spatiotemporal Variations of Single-Cell Mechanics in Xenopus laevis Embryos measured by AFM, 第38回特別研究会「走査型プローブ顕微鏡」(ICSPM32)

  Miki Yamamoto, Takahiro Kotani, Yuki Miyata, Yosuke Tsuboyama, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue, Takaharu Okajima
• 2024年6月

  Travel Award for Spemann-Mangold Centennial Symposium 2024, Shaping of morphogen gradients by extracellular interactors

  Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue
• 2023年8月

  Travel Award for the 19th International Xenopus Conference, Identification of tumor-related genes by gene expression analysis of spontaneous tumor tissue in Xenopus skin

  Kazuki Kitamura, Takayoshi Yamamoto, Haruki Ochi, Makoto Suzuki, Nanoka Suzuki, Takeshi Igawa, Tadashi Yoshida, Mitsuru Futakuchi, Hajime Ogino, Tatsuo Michiue
• 2023年8月

  Travel Award for the 19th International Xenopus Conference, Mechanical force is necessary for neural crest specification in Xenopus

  Toki Kaneshima, Masaki Ogawa, Takayoshi Yamamoto, Yosuke Tsuboyama, Yuki Miyata, Takahiro Kotani, Takaharu Okajima, Tatsuo Michiue
• 2023年8月

  Travel Award for 19th International Xenopus Conference, Robust and quick shaping of morphogen gradient with receptor feedback and heparan sulfate

  Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue
• 2021年12月

  令和3年度業務改革総長賞 (TA 費申請業務の効率化), 東京大学

  山元孝佳, 近藤興(基礎生命科学実験)
• 2016年11月

  優秀ポスター賞, Vg1とDerrièreはNodal1の細胞外における分布様式を変化させる, 第39回日本分子生物学会大会

  池田 貴史, 山元 孝佳, 平良 眞規
• 2016年11月

  優秀ポスター賞, BMPの分布およびシグナル範囲は分泌性アンタゴニストと2つの異なるヘパラン硫酸によって調節されている, 第39回日本分子生物学会大会

  山元 孝佳, 平良 眞規
• 2014年6月

  ポスター賞, The role of heparan sulfate proteoglycan nanostructures in morphogen gradient formation and signaling reception, 47th Annual Meeting of JSDB Co-sponsored by APDBN

  Takayoshi Yamamoto, Yusuke Mii, Masanori Taira

その他

• 構造化アカデミック・ポートフォリオ(SAP; Structured Academic Portfolio)作成ワークショップ 修了

  2017年3月

  日本高等教育開発協会、第 31 号
• 東京大学 FFP(フューチャーファカルティプログラム)修了(東京大学、第 8 期)

  2017年3月
• 高等学校教諭 専修免許状 (理科)

  2009年3月

担当経験のある科目(授業)

• 2024年4月 - 現在

  選択環境科学I (東邦大学医学部)
• 2021年9月 - 現在

  生命 (聖徳大学)
• 2018年4月 - 現在

  基礎生命科学実験 (東京大学)
• 2018年4月 - 現在

  生命科学実験 (東京大学)
• 2017年9月 - 2021年3月

  生物とその環境 (聖徳大学)
• 2016年4月 - 2018年3月

  生化学 (早稲田速記医療福祉専門学校看護科)
• 2017年4月 - 2017年9月

  SEITOKU Academic Literacy II(数学教養科目) (聖徳大学)

論文

• Mapping Single‐Cell Mechanics in the Early Embryogenesis of Xenopus laevis Using Atomic Force Microscopy

  Miki Yamamoto, Takayoshi Yamamoto, Takahiro Kotani, Yuki Miyata, Tatsuo Michiue, Takaharu Okajima

  Development, Growth & Differentiation 2025年12月3日 査読有り
• Tension-induced enhancement of SIX1 expression during preplacodal ectoderm differentiation from human induced pluripotent stem cells.

  Seungtae Kim, Ayumi Horikawa, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue

  The International journal of developmental biology 69(2) 61-69 2025年6月13日 査読有り
• Identification of N-acetyl-rich heparan sulfate binding motifs and their role in expanding BMP distribution and signaling by Cerberus

  Takayoshi Yamamoto, Yusuke Mii, Hidetoshi Saiga, Tatsuo Michiue, Masanori Taira

  bioRxiv 2025年4月19日 筆頭著者
• Evaluation of Pancreatic β-cell Differentiation Efficiency of Human iPSC Lines for Clinical Use

  Ayumi Horikawa, Kyoko Tsuda, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue

  Current Stem Cell Research & Therapy 2024年1月5日 査読有り
• Enhancement of neural crest formation by mechanical force in Xenopus development.

  Toki Kaneshima, Masaki Ogawa, Takayoshi Yamamoto, Yosuke Tsuboyama, Yuki Miyata, Takahiro Kotani, Takaharu Okajima, Tatsuo Michiue

  The International journal of developmental biology 68(1) 25-37 2024年 査読有り
• Identification of tumor-related genes via RNA sequencing of tumor tissues in Xenopus tropicalis.

  Kazuki Kitamura, Takayoshi Yamamoto, Haruki Ochi, Makoto Suzuki, Nanoka Suzuki, Takeshi Igawa, Tadashi Yoshida, Mitsuru Futakuchi, Hajime Ogino, Tatsuo Michiue

  Scientific reports 13(1) 13214-13214 2023年8月14日 査読有り
• The Helicobacter pylori CagA oncoprotein disrupts Wnt/PCP signaling and promotes hyperproliferation of pyloric gland base cells

  Atsushi Takahashi-Kanemitsu, Mengxue Lu, Christopher Takaya Knight, Takayoshi Yamamoto, Takuo Hayashi, Yusuke Mii, Takuya Ooki, Ippei Kikuchi, Akira Kikuchi, Nick Barker …

  Science Signaling 16(794) eabp9020 2023年7月18日 査読有り
• Chemical inhibitors of cyclin-dependent kinase (CDKi) improve pancreatic endocrine differentiation of iPS cells

  Heming Ning, Ayumi Horikawa, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue

  In Vitro Cellular & Developmental Biology - Animal 59(6) 2023年7月5日 査読有り
• The heparan sulfate modification enzyme, Hs6st1, governs Xenopus neuroectodermal patterning by regulating distributions of Fgf and Noggin

  Takayoshi Yamamoto (corresponding author), Toki Kaneshima, Kohei Tsukano, Tatsuo Michiue

  Developmental Biology 496 87-94 2023年4月 査読有り筆頭著者責任著者
• Ndst1, a heparan sulfate modification enzyme, regulates neuroectodermal patterning by enhancing Wnt signaling in Xenopus

  Takayoshi Yamamoto (corresponding author), Yuta Kambayashi, Kohei Tsukano, Tatsuo Michiue

  Development, Growth & Differentiation 65(3) 2023年3月3日 査読有り招待有り筆頭著者責任著者
• Positive feedback regulation of frizzled-7 expression robustly shapes a steep Wnt gradient in Xenopus heart development, together with sFRP1 and heparan sulfate

  Takayoshi Yamamoto (corresponding author), Yuta Kambayashi, Yuta Otsuka, Boni A Afouda, Claudiu Giuraniuc, Tatsuo Michiue, Stefan Hoppler

  eLife 11 2022年8月9日 査読有り筆頭著者責任著者
• Xenopus Dusp6 modulates FGF signaling to precisely pattern pre-placodal ectoderm.

  Kohei Tsukano, Takayoshi Yamamoto, Tomoko Watanabe, Tatsuo Michiue

  Developmental biology 488 81-90 2022年5月19日 査読有り
• Evolution of hes gene family in vertebrates: the hes5 cluster genes have specifically increased in frogs.

  Aya Kuretani, Takayoshi Yamamoto, Masanori Taira, Tatsuo Michiue

  BMC ecology and evolution 21(1) 147-147 2021年7月29日 査読有り
• A simple method of hiPSCs differentiation into insulin-producing cells is improved with vitamin C and RepSox.

  Ayumi Horikawa, Keiko Mizuno, Kyoko Tsuda, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue

  PloS one 16(7) e0254373 2021年 査読有り
• De novo transcription of multiple Hox cluster genes takes place simultaneously in early Xenopus tropicalis embryos.

  Mariko Kondo, Megumi Matsuo, Kento Igarashi, Yoshikazu Haramoto, Takayoshi Yamamoto, Yuuri Yasuoka, Masanori Taira

  Biology open 8(3) 2019年3月4日 査読有り
• Embryonic lethality is not sufficient to explain hourglass-like conservation of vertebrate embryos

  Yui Uchida, Masahiro Uesaka, Takayoshi Yamamoto, Hiroyuki Takeda, Naoki Irie

  EvoDevo 9(1) 7 2018年3月16日 査読有り
• Fam46a regulates BMP-dependent pre-placodal ectoderm differentiation in Xenopus

  Tomoko Watanabe, Takayoshi Yamamoto, Kohei Tsukano, Sayuki Hirano, Ayumi Horikawa, Tatsuo Michiue

  Development 2018年1月1日
• FRET-based tension measurement across actin-associated mechanotransductive structures using Lima1.

  Sayuki Hirano, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue

  The International journal of developmental biology 62(9-10) 631-636 2018年 査読有り
• Roles of two types of heparan sulfate clusters in Wnt distribution and signaling in Xenopus

  Yusuke Mii*, Takayoshi Yamamoto* (*co-first author), Ritsuko Takada, Shuji Mizumoto, Makoto Matsuyama, Shuhei Yamada, Shinji Takada, Masanori Taira

  NATURE COMMUNICATIONS 8(1) 1973 2017年12月 査読有り筆頭著者
• Comprehensive analyses of hox gene expression in Xenopus laevis embryos and adult tissues

  Mariko Kondo, Takayoshi Yamamoto, Shuji Takahashi, Masanori Taira

  DEVELOPMENT GROWTH & DIFFERENTIATION 59(6) 526-539 2017年8月 査読有り

MISC

• 生命科学・医学を学ぶ大学生のためのウシガエルとウチダザリガニを教材とした麻酔および解剖方法の開発

  原田 一貴, 福田 裕子, 小田 有沙, 近藤 興, 山元 孝佳, 道上 達男

  生物教育 65(3) 2024年 査読有り
• 「活かす」を意識した看護学校における生化学教育の一例

  山元孝佳, 内田唯

  教育研究(早稲田速記医療福祉専門学校紀要) (35) 2017年
• 【調査研究】大学の数学的リテラシー科目における リフレクションの学修効果の検討

  難波阿丹, 長濱和代, 山元孝佳

  聖徳大学研究紀要 28(50) 173-179 2017年 査読有り

書籍等出版物

• 基礎生命科学実験 第3版

  東京大学教養学部基礎生命科学実験編集委員会 (担当:共著)

  東京大学出版会 2021年4月
• 今月の150〜200字でわかる海外の注目論文

  山元 孝佳

  細胞工学(秀潤社) 2016年3月
• 最新 バイオ論文解説総集編1

  山元 孝佳 (担当:分担執筆)

  秀潤社 2015年9月
• 伝えるから伝わる科学報道へ

  白井 福寿, 山元 孝佳, 馬谷 千恵, 村山 知, 有馬 陽介

  実験医学 2014年 10 月号(羊土社) 2014年10月
• 高校生からのバイオ科学の最前線

  片桐友二 (担当:分担執筆)

  2014年8月 (ISBN: 4535786534)
• 大学生はリッチガール&ボーイ!?―教育格差問題への対応策

  山元 孝佳, 松原 惇高

  実験医学 2013 年 10 月号(羊土社) 2013年10月
• 東日本大震災―若手が直面する問題と支援策

  山元 孝佳, 鉞 陽介, 飯島 玲生

  実験医学 2011 年 9 月号(羊土社) 2011年9月

主要な講演・口頭発表等

• モルフォゲンと形態形成の安定性―心臓と神経におけるフィードバック機構

  山元 孝佳

  第131回日本解剖学会総会 2026年3月25日 招待有り
• Extracellular Control of Morphogen Gradient Formation and Robustness

  山元 孝佳

  エクセター大学(招待講演) 2026年3月 招待有り
• From Diffusion to Mechanics: Multiscale Control of Embryonic Patterning

  Takayoshi Yamamoto

  アバディーン大学(招待講演) 2026年3月 招待有り
• Spatiotemporal Variations of Single-Cell Mechanics in Xenopus laevis Embryos measured by AFM

  Miki Yamamoto, Takahiro Kotani, Yuki Miyata, Yosuke Tsuboyama, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue, Takaharu Okajima

  第38回特別研究会「走査型プローブ顕微鏡」(ICSPM32) 2024年11月
• Mechanical Measurements of Single Cells in the Animal Pole of Xenopus Embryos by Atomic Force Microscopy

  Miki Yamamoto, Takahiro Kotani, Yuki Miyata, Yosuke Tsuboyama, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue, Takaharu Okajima

  1st Asian Xenopus Conference 2024 2024年11月
• カエル胚とシミュレーションで明らかにする、モルフォゲン分布制御機構の根本原理

  山元 孝佳, 道上 達男

  日本動物学会第95回長崎大会 2024年9月 招待有り
• The involvement of mechanical force in ectoderm patterning of Xenopus embryo

  Tatsuo Michiue, Takayoshi Yamamoto

  Spemann-Mangold Centennial Symposium 2024 2024年9月
• Shaping of morphogen gradients by extracellular interactors

  Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue

  Spemann-Mangold Centennial Symposium 2024 2024年9月
• Mechanical force is necessary for neural crest specification in Xenopus

  Toki Kaneshima, Masaki Ogawa, Takayoshi Yamamoto, Yosuke Tsuboyama, Yuki Miyata, Takahiro Kotani, Takaharu Okajima, Tatsuo Michiue

  19th International Xenopus Conference 2023年8月
• Robust and quick shaping of morphogen gradient with receptor feedback and heparan sulfate

  Takayoshi Yamamoto, Stefan Hoppler, Tatsuo Michiue

  19th International Xenopus Conference 2023年8月 招待有り
• Wnt-受容体フィードバックによるロバストな心膜形成―ウェットとドライの相補的アプローチ

  山元 孝佳, 上林勇太, 大塚祐太, 道上達男, Stefan Hoppler

  第45回日本分子生物学会年会 2022年11月
• Receptor-feedback robustly and quickly shapes Wnt gradient in heart development

  Takayoshi Yamamoto, Yuta Kambayashi, Yuta Otsuka, Boni Afouda, Claudiu Giuraniuc, Tatsuo Michiue, Stefan Hoppler

  Wnt 2022 EMBO Workshop 2022年11月
• Dusp6 is required for robust patterning of pre-placodal ectoderm by regulating FGF signal activity in Xenopus embryos

  Kohei Tsukano, Tomoko Watanabe, Takayoshi Yamamoto, Tatsuo Michiue

  18th International Xenopus Conference 2021年8月
• Receptor Feedback Regulation of fzd7 Expression Shapes Wnt6 Signal Range in Early Heart Development

  Takayoshi Yamamoto, Yuta Kambayashi, Stefan Hoppler, Tatsuo Michiue

  Wnt meeting 2021 2021年1月 招待有り
• The key is the binding partner: the range of morphogen-mediated signaling is regulated by the antagonists and two different types of heparan sulfate

  Takayoshi Yamamoto

  アバディーン大学(招待講演) 2018年12月 招待有り
• The key is the binding partner: the range of morphogen-mediated signaling is regulated by the antagonists and two different types of heparan sulfate

  Takayoshi Yamamoto

  ヨーク大学(招待講演) 2018年12月 招待有り
• 動物のからだづくりにおける位置情報 ―モルフォゲンの分布を決める新たなしくみ

  山元 孝佳

  明治大学大学院特別講義(招待講演) 2018年7月 招待有り
• 修飾状態の異なる2種類のヘパラン硫酸による モルフォゲンの分布および活性化範囲の制御機構

  山元 孝佳, 三井 優輔, 高田 慎治, 平良 眞規

  次世代両生類研究会(招待講演) 2017年8月 招待有り
• Heparan sulfate and its nascent chain heparosan form distinct clusters with antagonistic roles for Wnt distribution and signaling

  山元 孝佳

  Wnt研究会2016 2016年11月
• Distribution and signaling of Wnt and BMP ligands are modulated by secreted antagonists and heparosan/heparan sulfate proteoglycans in Xenopus embryos

  Takayoshi Yamamoto, Yusuke Mii, Shinji Takada, Masanori Taira

  16th International Xenopus Conference 2016年8月
• Roles of glypicans and NDST1 in the formation of two distinct types of heparan sulfate nanostructures involved in extracellular distributions of Wnt and sFRP

  Takayoshi Yamamoto, Yusuke Mii, Shinji Takada, Masanori Taira

  日本発生生物学会第48回大会 2015年6月
• The Role of Heparan Sulfate Nanostructures in Morphogen Gradient Formation and Signaling Reception

  Masanori Taira, Yusuke Mii, Takayoshi Yamamoto, Shinji Takada

  15th International Xenopus Conference 2014年8月
• The cilia-dependency of hedgehog signaling in fish

  Takayoshi Yamamoto, Tatsuya Tsukahara, Hiroyuki Takeda

  第46回日本発生生物学会大会 2013年5月

所属学協会

• 2026年1月 - 現在

  日本生物教育学会
• 2020年8月 - 現在

  日本動物学会
• 2012年2月 - 現在

  日本発生生物学会
• 2008年7月 - 現在

  日本分子生物学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

• BMP抑制因子の膜結合性が規定するシグナル活性化・抑制機構

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 2026年4月 - 2029年3月

  山元 孝佳
• 神経外胚葉分化における、ヘパラン硫酸修飾酵素によるモルフォゲンの分布制御

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

  山元 孝佳, 道上 達男
• 胚発生過程における新規へパラン硫酸クラスターの機能

  公益財団法人 山田科学振興財団 研究援助 2023年10月 - 2025年3月

  山元 孝佳
• ツメガエル胚の外胚葉パターニングにおける細胞張力依存的シグナル伝達制御機構

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

  道上 達男, 山元 孝佳
• 細胞運命を決める、受け手細胞の力学的特性

  NARISHIGE 公益信託 成茂動物科学振興基金 2022年10月 - 2023年9月

  山元 孝佳
• Toll/Irak1の新規機能:頭部を誘導する分子メカニズムの解明

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究 2019年4月 - 2022年3月

  山元 孝佳
• 脊椎動物胚の細胞にかかる力が予定運命に与える影響の検証

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

  道上 達男, 山元孝佳
• Regulation of WNT signalling distance in heart development

  大和日英基金 重点助成 2019年8月 - 2020年10月

  山元 孝佳
• 公益財団法人 加藤記念バイオサイエンス振興財団 国際交流助成

  2016年4月 - 2016年9月

  山元 孝佳