奥本 裕

基本情報

所属

京都大学 大学院農学研究科 農学専攻 教授

学位

博士(農学)

農学修士

J-GLOBAL ID

200901021427273844

researchmap会員ID

1000028103

外部リンク

http://www.ikushu.kais.kyoto-u.ac.jp/

研究キーワード

• イネ
• トランスポゾン
• 突然変異
• 遺伝子分析
• 転移機構
• 転移因子
• 遺伝子発現
• 準同質遺伝子系統
• 転移
• ゲノム
• 穂ばらみ期耐冷性
• 耐冷性
• 穂ばらみ期対冷性
• QTL解析
• 連鎖分析
• 穂ばらみ期
• ストレス耐性
• 地下部
• 低温耐性
• mPing
• MITE
• RFLP
• QTL
• mutator
• RAPD
• yAc
• MITEs
• Rurm1
• RGII
• 植物生理
• 遺伝
• 育種学
• Bioresource Science
• Genetics
• Plant Breeding Science

研究分野

• 環境・農学 / 植物保護科学 /
• 環境・農学 / 遺伝育種科学 /
• ライフサイエンス / 植物分子、生理科学 /
• ライフサイエンス / 遺伝学 /

経歴

• 2011年 - 2015年

  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授

学歴

• - 1979年

  京都大学, 農学研究科, 育種学
• - 1979年

  京都大学
• - 1977年

  京都大学, 農学部, 農学科
• - 1977年

  京都大学

論文

• An easy, inexpensive, and sensitive method for the quantification of chitin in insect peritrophic membrane by image processing.

  Nakata R, Yoshinaga N, Teraishi M, Okumoto Y, Mori N

  Bioscience, biotechnology, and biochemistry 1-6 2019年5月 査読有り
• Accumulation of 9- and 13-KODEs in response to jasmonic acid treatment and pathogenic infection in rice.

  Sayaka Nishiguchi, Koichi Murata, Naoki Ube, Kotomi Ueno, Shin-Ichi Tebayashi, Masayoshi Teraishi, Yutaka Okumoto, Naoki Mori, Atsushi Ishihara

  Journal of pesticide science 43(3) 191-197 2018年8月20日 査読有り
• Biosynthesis and accumulation of GABA in rice plants treated with acetic acid.

  Shunsaku Isaji, Naoko Yoshinaga, Masayoshi Teraishi, Daisuke Ogawa, Etsuko Kato, Yutaka Okumoto, Yoshiki Habu, Naoki Mori

  Journal of pesticide science 43(3) 214-219 2018年8月20日 査読有り
• A fragmentation study of isoflavones by IT-TOF-MS using biosynthesized isotopes.

  Ryu Nakata, Naoko Yoshinaga, Masayoshi Teraishi, Yutaka Okumoto, Alisa Huffaker, Eric A Schmelz, Naoki Mori

  Bioscience, biotechnology, and biochemistry 82(8) 1309-1315 2018年8月 査読有り
• Induced phenylamide accumulation in response to pathogen infection and hormone treatment in rice (Oryza sativa).

  Noriko Morimoto, Kotomi Ueno, Masayoshi Teraishi, Yutaka Okumoto, Naoki Mori, Atsushi Ishihara

  Bioscience, biotechnology, and biochemistry 82(3) 407-416 2018年3月 査読有り
• Lineage-specific gene acquisition or loss is involved in interspecific hybrid sterility in rice

  Yohei Koide, Atsushi Ogino, Takanori Yoshikawa, Yuki Kitashima, Nozomi Saito, Yoshitaka Kanaoka, Kazumitsu Onishi, Yoshihiro Yoshitake, Takuji Tsukiyama, Hiroki Saito …

  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 115(9) E1995-E1962 2018年2月27日 査読有り
• Impairment of Lhca4, a subunit of LHCI, causes high accumulation of chlorophyll and the stay-green phenotype in rice

  Hiroshi Yamatani, Kaori Kohzuma, Michiharu Nakano, Tsuneaki Takami, Yusuke Kato, Yoriko Hayashi, Yuki Monden, Yutaka Okumoto, Tomoko Abe, Toshihiro Kumamaru …

  Journal of Experimental Botany 69(5) 1027-1035 2018年2月23日 査読有り
• QTLs underlying the genetic interrelationship between efficient compatibility of Bradyrhizobium strains with soybean and genistein secretion by soybean roots.

  Clarissien Ramongolalaina, Masayoshi Teraishi, Yutaka Okumoto

  PloS one 13(4) e0194671 2018年 査読有り
• Tracking the genome-wide outcomes of a transposable element burst over decades of amplification

  Lu Lu, Jinfeng Chen, Sofia M. C. Robb, Yutaka Okumoto, Jason E. Stajich, Susan R. Wessler

  PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 114(49) E10550-E10559 2017年12月 査読有り
• Detection of novel QTLs qDTH4.5 and qDTH6.3, which confer late heading under short-day conditions, by SSR marker-based and QTL-seq analysis

  Eri Ogiso-Tanaka, Tsuyoshi Tanaka, Keisuke Tanaka, Yasunori Nonoue, Takuji Sasaki, Erina Fushimi, Yohei Koide, Yutaka Okumoto, Masahiro Yano, Hiroki Saito

  BREEDING SCIENCE 67(2) 101-109 2017年 査読有り
• Identification of environmentally stable QTLs controlling Saponin content in Glycine max

  Masayoshi Teraishi, Yuka Tojo, Naohiro Yamada, Yutaka Okumoto

  BREEDING SCIENCE 67(2) 123-128 2017年 査読有り
• Inducible De Novo Biosynthesis of Isoflavonoids in Soybean Leaves by Spodoptera litura Derived Elicitors: Tracer Techniques Aided by High Resolution LCMS

  Ryu Nakata, Yuki Kimura, Kenta Aoki, Naoko Yoshinaga, Masayoshi Teraishi, Yutaka Okumoto, Alisa Huffaker, Eric A. Schmelz, Naoki Mori

  JOURNAL OF CHEMICAL ECOLOGY 42(12) 1226-1236 2016年12月 査読有り
• The Tyrosine Aminomutase TAM1 Is Required for β-Tyrosine Biosynthesis in Rice.

  Yan J, Aboshi T, Teraishi M, Strickler SR, Spindel JE, Tung CW, Takata R, Matsumoto F, Maesaka Y, McCouch SR …

  The Plant cell 27(4) 1265-1278 2015年4月 査読有り
• Identification of β-phenylalanine as a non-protein amino acid in cultivated rice, Oryza sativa.

  Yokoo T, Takata R, Yan J, Matsumoto F, Teraishi M, Okumoto Y, Jander G, Mori N

  Communicative & integrative biology 8(5) 1-5 2015年 査読有り
• The effects of phytochrome-mediated light signals on the developmental acquisition of photoperiod sensitivity in rice

  Yoshihiro Yoshitake, Takayuki Yokoo, Hiroki Saito, Takuji Tsukiyama, Xu Quan, Kazunori Zikihara, Hitomi Katsura, Satoru Tokutomi, Takako Aboshi, Naoki Mori …

  SCIENTIFIC REPORTS 5 7709 2015年1月 査読有り
• Wide genetic variation in phenolic compound content of seed coats among black soybean cultivars

  Siviengkhek Phommalath, Masayoshi Teraishi, Takanori Yoshikawa, Hiroki Saito, Takuji Tsukiyama, Tetsuya Nakazaki, Takatoshi Tanisaka, Yutaka Okumoto

  BREEDING SCIENCE 64(4) 409-415 2014年12月 査読有り
• Insect-induced daidzein, formononetin and their conjugates in soybean leaves.

  Shinichiro Murakami, Ryu Nakata, Takako Aboshi, Naoko Yoshinaga, Masayoshi Teraishi, Yutaka Okumoto, Atsushi Ishihara, Hironobu Morisaka, Alisa Huffaker, Eric A Schmelz …

  Metabolites 4(3) 532-46 2014年7月4日 査読有り
• Early Embryogenesis-Specific Expression of the Rice Transposon Ping Enhances Amplification of the MITE mPing

  Shota Teramoto, Takuji Tsukiyama, Yutaka Okumoto, Takatoshi Tanisaka

  PLOS GENETICS 10(6) e1004396 2014年6月 査読有り
• mPing: The bursting transposon

  Ken Naito, Yuki Monden, Kanako Yasuda, Hiroki Saito, Yutaka Okumoto

  BREEDING SCIENCE 64(2) 109-114 2014年6月 査読有り
• Se14, Encoding a JmjC Domain-Containing Protein, Plays Key Roles in Long-Day Suppression of Rice Flowering through the Demethylation of H3K4me3 of RFT1

  Takayuki Yokoo, Hiroki Saito, Yoshihiro Yoshitake, Quan Xu, Takehito Asami, Takuji Tsukiyama, Masayoshi Teraishi, Yutaka Okumoto, Takatoshi Tanisaka

  PLOS ONE 9(4) e96064 2014年4月 査読有り

MISC

• イネ群落形成パターンに対する出穂期突然変異遺伝子の効果

  伏見栄利奈, 齊藤大樹, 小出陽平, 小出陽平, GUO W, 二宮正士, 谷坂隆俊, 谷坂隆俊, 奥本裕

  育種学研究 18 126 2016年3月21日
• DNAメチル化がイネ自律性転移因子Pingの結合能におよぼす効果

  築山拓司, 小野原一暢, 田中幹也, 齊藤大樹, 奥本裕, 寺石政義, 井上國世, 井上國世, 谷坂隆俊, 谷坂隆俊

  育種学研究 18 91 2016年3月21日
• ダイズサポニン含量を制御する新たなQTL

  寺石政義, 東条由花, 山田直弘, 築山拓司, 奥本裕

  育種学研究 18 116 2016年3月21日
• ジャスモン酸処理したイネ葉におけるβ‐チロシンの蓄積

  網干貴子, YAN Jian, 寺石政義, 奥本裕, 石原亨, JANDER Georg, 森直樹

  日本農薬学会大会講演要旨集 41st 159 2016年3月17日
• イネの様々な品種におけるファイトアレキシン,サクラネチンとナリンゲニンの蓄積

  北野生薫, 西口沙也加, 上野琴巳, 藪田行哲, 寺石政義, 奥本裕, 森直樹, 石原亨

  日本農薬学会大会講演要旨集 41st 168 2016年3月17日
• イネにおける植物ホルモン処理と病原菌感染によるフェニルアミド類の誘導

  森本紀子, 北野生薫, 上野琴巳, 上野誠, 寺石政義, 奥本裕, 森直樹, 石原亨

  日本農薬学会大会講演要旨集 41st 166 2016年3月17日
• イネ非自律性転移因子mPingは選択スプライシングを誘発する

  琴梨世, 築山拓司, 稲垣晴香, 齊藤大樹, 寺石政義, 奥本裕, 谷坂隆俊, 谷坂隆俊

  日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 87th 106 2015年9月10日
• イネのジャポニカ種およびインディカ種におけるファイトアレキシン蓄積の解析

  北野生薫, 西口沙也加, 吉本理子, 中島廣光, 藪田行哲, 上中弘典, 寺石政義, 奥本裕, 森直樹, 石原亨

  日本農薬学会大会講演要旨集 40th 122 2015年3月18日
• イネのジャポニカ種およびインディカ種におけるファイトアレキシン,サクラネチンの蓄積

  北野生薫, 西口沙也加, 吉本理子, 中島廣光, 藪田行哲, 上中弘典, 寺石政義, 奥本裕, 森直樹, 石原亨

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 3E11P18 (WEB ONLY) 2015年3月5日
• ジャスモン酸処理したイネ葉におけるβ‐tyrosineの蓄積

  網干貴子, YAN Jian, 寺石政義, 石原亨, 奥本裕, JANDER Georg, 森直樹

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 3E11P16 (WEB ONLY) 2015年3月5日
• ダイズ葉にflavonoid類を誘導するFACs

  青木謙太, 中田隆, 吉永直子, 寺石政義, 奥本裕, 小野肇, 西田律夫, 森直樹, SCHMELZ Eric

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 2E11A13 (WEB ONLY) 2015年3月5日
• ハスモンヨトウ幼虫の食害に対するダイズ毛茸の化学的応答

  中田隆, 網干貴子, 吉永直子, 石原亨, 寺石政義, SCHMELZ Eric, 小野肇, 西田律夫, 奥本裕, 森直樹

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 2E21P01 (WEB ONLY) 2015年3月5日
• 植物ホルモンによるイネ新規代謝物β‐チロシンの誘導と分布

  前坂佳宏, 網干貴子, 寺石政義, 奥本裕, 石原亨, 吉永直子, 小野肇, 西田律夫, 森直樹

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 3E11P17 (WEB ONLY) 2015年3月5日
• イネユビキチン様タンパク質遺伝子Rurm1がメチルビオロゲンによって誘導される酸化ストレス応答におよぼす効果

  河西 恵, 築山 拓司, 寺石 政義, 奥本 裕, 谷坂 隆俊

  作物研究 60 55-57 2015年
• 低酸素緩和および吸水緩和がダイズ発芽時冠水耐性QTLに及ぼす影響

  西田昌弘, 白井利奈, 寺石政義, 築山拓司, 奥本裕

  育種学研究 16 155 2014年9月26日
• イネトランスポゾンmPingの転移活性を制御する因子の探索

  寺本翔太, 築山拓司, 谷坂隆俊, 奥本裕

  育種学研究 16 239 2014年9月26日
• イネ出穂期遺伝子hd3a変異体の個葉および群落蒸散特性の解析

  岩橋優, 田中佑, 伊藤真, 吉竹良洋, 齊藤大樹, 奥本裕, 本間香貴, 白岩立彦

  日本作物学会講演会要旨集 238th 58 2014年8月29日
• イネ科作物の量的形質遺伝子の同定 第4章 イネの生理形態に関する形質の解析 1 イネ基本栄養生長性を支配する遺伝子群の解析(QTL4001)

  奥本裕, 齊藤大樹, 谷坂隆俊

  農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (512) 151-156 2014年3月31日
• ゲノム研究成果を活用した大豆等イネ科以外の新品種開発 第2章 ダイズの重要形質に関わる遺伝子の解明(1)ダイズの発芽時冠水抵抗性遺伝子の同定(DD2010)

  谷坂隆俊, 奥本裕, 寺石政義

  農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (514) 29-31 2014年3月31日
• イネ非自律性転移因子mPingによる転写産物の改変

  KUM R, 築山拓司, 稲垣晴香, 谷坂隆俊, 奥本裕

  育種学研究 16 129 2014年3月21日

書籍等出版物

• 遺伝学の基礎

  北柴 大泰, 西尾 剛, 笹沼 恒男 (担当:分担執筆, 範囲:量的形質の遺伝)

  朝倉書店 2018年 (ISBN: 9784254405491)
• 植物育種学

  西尾 剛, 吉村 淳, 貴島 祐治, 安井 秀, 奥本 裕, 佐藤 和広, 高畑 義人, 北柴 大泰, 北野 英己, 奥野 員敏

  文永堂出版 2012年 (ISBN: 9784830041228)
• イネ・トランスポゾンmPingの起源と転移活性獲得機構

  奥本 裕, 京都大学大学院農学研究科

  [奥本裕] 2008年
• イネ・トランスポゾンmPingを植物体内で可動化する遺伝要因

  奥本 裕, 京都大学大学院農学研究科

  [奥本裕] 2006年
• Genetic variability in cesium resistance in rice (Oryza sativa L. )

  奥本 裕

  Plant Nutrition-Molecular Biology and Genetics,/,333-339 1999年
• Genetic variability in cesium resistance in rice(Oryza sativa L. )

  奥本 裕

  Plant Nutrition-Molecular Biology and Genetics. (KLUWER ACADEMICPUB. ),/,333-339 1999年
• イネmutator活性化遺伝子座近傍の細密分子遺伝学的地図の作成

  奥本 裕

  [奥本裕] 1996年
• 植物遺伝育種学実験法(分担執筆)

  奥本 裕

  朝倉書店, 1995年
• RFLPを用いたイネQTL(量的形質遺伝子座)解析法の開発

  奥本 裕, 京都大学大学院農学研究科

  [奥本裕] 1994年
• Difference of the Heading-time genes of rice variety Taichung 65 from those of Japanese rice varieties

  奥本 裕

  Pro. of the 7th Inter. Cong. of SABRAO, 1993年
• 台湾イネ品種台中65号と日本品種の出穂期遺伝子に関する差異

  奥本 裕

  第7回国際SABRAO論文集, 1993年
• genotypic difference of the response to light interruption in Japanese rice varieties

  奥本 裕

  Rice genetics (]G0002[), 1992年
• Linkage analysis for the gametic lethal gene of a rice variety Koshihikari and the semi-dwarf gene induced in kosihikari

  奥本 裕

  Pro. of the 6th Internatl. Congr. of SABRAO, 1989年
• Effects of large grain mutation on ripening characteristics in rice

  奥本 裕

  Pro. of the 6th Internatl. Congr. of SABRAO, 1989年
• Analysis of genes controlling heading-time in Japanese rice

  奥本 裕

  Rice Genetics I, 1986年
• Science of the rice plant

  奥本 裕

  Nobunkyo,173-178
• 稲学大成(幼植物)

  奥本 裕

  農文協,173-178

講演・口頭発表等

• ダイズ種子に冠水抵抗性を付与する育種

  近畿作物・育種研究会 公開シンポジウム 2009年

所属学協会

• 欧州作物育種学会(EUCARPIA)
• 米国作物学会(Crop Science Society of America)
• サブラオ(The Society for the Advancement of Breeding Researches)
• 日本育種学会(Asia and Oceania)

共同研究・競争的資金等の研究課題

• ダイズの発芽前冠水抵抗性に関するDNAマーカーの作出

  委託研究 2002年
• ダイズ種子中へのイソフラボンの集積機構に関する遺伝解析

  委託研究 2002年
• コムギ種子の貯蔵タンパク質に関する遺伝的多様性の解析
• イネの耐冷性に関する遺伝解析
• イネ・トランスポゾンmPingの育種的利用に関する研究
• イネの出穂期に関する遺伝機構の解析
• Genetical analysis for cool weather resistance in rice
• Studies on the utilization of a mutator induced in rice
• Genetical analysis for heading-time of rice

産業財産権

• 特開2006-081511 ダイズにおけるイソフラボン産生レベルを判定するためのDNAマーカー

  谷坂 隆俊, 奥本 裕, 山田 利昭, 奥平 武則, 山田 勝重, 戸田 登志也, 寺井 雅一