リ シン

基本情報

所属

大阪大学 D3センター 准教授

(兼任)大学院情報科学研究科 准教授

(兼任)工学部電子情報工学科 准教授

学位

博士(工学)

連絡先

li.chen.d3cosaka-u.ac.jp

研究者番号

10973349

ORCID iD

https://orcid.org/0000-0002-8784-8148

J-GLOBAL ID

202401000590832010

Researcher ID

LCD-7956-2024

researchmap会員ID

R000067364

研究キーワード

• 生成AI、AI創薬、深層学習、ビッグデータ

研究分野

• 情報通信 / 生命、健康、医療情報学 / AI創薬、医療データ分析、生命データ分析
• 情報通信 / 知能情報学 / 生成AI、深層学習、ビッグデータ

経歴

• 2025年6月 - 現在

  国立情報学研究所(NII)(兼任)
• 2025年6月 - 現在

  名古屋大学, 招へい教員
• 2025年2月 - 現在

  大阪大学, 工学部電子情報工学科, 准教授
• 2025年2月 - 現在

  大阪大学, (兼任)大学院情報科学研究科, 准教授
• 2025年2月 - 現在

  大阪大学, D3センター, 准教授
• 2023年4月 - 2025年1月

  名古屋大学大学院情報学研究科 (JSPS外国人特別研究員)
• 2021年2月 - 2023年3月

  九州工業大学大学院情報工学研究院
• 2019年10月 - 2021年1月

  広島大学大学院先進理工系科学研究科

学歴

• 2016年10月 - 2019年9月

  広島大学大学院, 先進理工系科学研究科
• 2014年10月 - 2016年9月

  広島大学, 大学院先進理工系科学研究科

委員歴

• 2026年5月 - 現在

  Discover Computer Vision of Springer, Editorial Board
• 2026年2月 - 現在

  ACM SIGKDD Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (SIGKDD), Program Committee
• 2026年1月 - 現在

  Knowledge Discovery and Data Mining (KDD), Knowledge Discovery and Data Mining (KDD)
• 2025年12月 - 現在

  IEEE International Conference on Data Mining (IEEE ICDM), Area Chair
• 2025年12月 - 現在

  IEEE Senior Member, Senior Member
• 2025年12月 - 現在

  日本データベース学会, 会員
• 2025年10月 - 現在

  International World Wide Web Conference (WWW), Program Committee
• 2025年10月 - 現在

  ACM Transactions on Probabilistic Machine Learning, Journal Reviewer
• 2025年3月 - 現在

  Array, Guest Editor
• 2025年 - 現在

  ACM International Conference on Multimedia (ACM MM), Program Committee
• 2024年1月 - 現在

  Neural Computing and Applications (NCAA), Journal Reviewer
• 2024年1月 - 現在

  International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI), Program Committee
• 2024年1月 - 現在

  International Conference on Learning Representations (ICLR), Program Committee
• 2023年10月 - 現在

  International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AISTATS), Program Committee
• 2023年 - 現在

  European Conference on Artificial Intelligence (ECAI), Program Committee
• 2023年 - 現在

  IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (IEEE BIBM), Program Committee
• 2023年 - 現在

  IEEE International Conference on Big Data (IEEE BigData), Program Committee
• 2021年1月 - 現在

  The International Conference on Machine Learning (ICML), Program Committee
• 2021年1月 - 現在

  Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS), Program Committee
• 2021年1月 - 現在

  AAAI conference on artificial intelligence (AAAI), Program Committee

主要な受賞

• 2024年2月

  AAAI Outstanding Paper Award, AAAI 2024

論文

• Gene Expression–Informed Jointly Controlled Generative Modeling for Precision Molecular Design

  Hang Yuan, Chen Li, Wenjun Ma, Tadahiko Murata, Yuncheng Jiang

  ACM MM 2026 2026年11月 査読有り責任著者
• DataLight: Data-Centric Offline Reinforcement Learning for Traffic Signal Control

  Liang Zhang, Yutong Zhang, Xiaofeng Gao, Chen Li

  ECML-PKDD 2026 2026年9月 査読有り最終著者責任著者
• Reinforcement Learning-Driven Multiproperty Optimization in Molecular Design Using Multicontext Transcriptome Data

  Yuki Matsukiyo, Chen Li, Yoshihiro Yamanishi

  Journal of Chemical Information and Modeling 2026年8月 査読有り
• Data augmentation with attentional feature aggregation for node classification in GNNs

  Guangquan Lu, Shilong Lin, Yuxuan Hu, Debo Cheng, Chen Li, Shichao Zhang

  Information Fusion 130 104089-104089 2026年6月
• A Reinforcement Learning-driven Transformer GAN for Molecular Generation

  Chen Li, Huidong Tang, Ye Zhu, Yoshihiro Yamanishi

  Machine Intelligence Research 2026年6月1日 査読有り筆頭著者責任著者
• TAD-Bench: A Comprehensive Benchmark for Embedding-Based Text Anomaly Detection

  Yang Cao, Sikun Yang, Chen Li, Haolong Xiang, Lianyong Qi, Bo Liu, Rongsheng Li, Ming Liu

  Machine Learning 2026年5月
• Image Captioning via Masked Conditional Diffusion

  Jiayi Zhou, Chen Li, Huidong Tang, Sayaka Kamei, Shuai Jiang, Yasuhiko Morimoto

  ADMA 2025 2026年5月 査読有り
• Boundary value test input generation using a large language model: Fault detection and coverage analysis

  X. Guo, C. Li, T. Tsuchiya

  ADMA 2025 2026年5月 査読有り
• Leveraging deep AUC maximisation for enhanced active learning in named entity recognition

  W. Tan, D. Nguyen, C. Li, W. Buntine, H. Zhao, L. Du

  ADMA 2025 2026年5月 査読有り
• テキスト条件付き拡散モデルによる分子生成

  天澤 賢哉, 袁 航, 李晨, 村田 忠彦

  DEIM2026 2026年3月
• Gx2Mol: De Novo Generation of Hit-Like Molecules from Gene Expression Profiles

  Chen Li, Yoshihiro Yamanishi

  Lecture Notes in Computer Science 16015 2026年 査読有り
• InstGAN: Instant actor-critic-driven GAN for de novo molecule generation and property optimization

  H Tang, C Li, S Kamei, Y Yamanishi, Y Morimoto

  IJCAI 2025 2025年9月 査読有り責任著者
• 深層学習による遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた創薬標的分子の予測と希少疾患への応用

  難波里子, 李晨, 大谷則子, 山西芳裕

  日本薬学会第145回 2025年3月
• SSL-VQ: Vector-quantized variational autoencoders for semi-supervised prediction of therapeutic targets across diverse diseases

  Satoko Namba, Chen Li, Noriko Otani, Yoshihiro Yamanishi

  Bioinformatics 2025年1月28日
• De novo generation of dual-target compounds using artificial intelligence

  Kasumi Yasuda, Francois Berenger, Kazuma Amaike, Ayaka Ueda, Tomoya Nakagomi, Genki Hamasaki, Chen Li, Noriko Yuyama Otani, Kazuma Kaitoh, Koji Tsuda …

  iScience 28(1) 111526-111526 2025年1月
• AI-driven transcriptome profile-guided hit molecule generation

  Chen Li, Yoshihiro Yamanishi

  Artificial Intelligence 2025年1月 筆頭著者責任著者
• Advancing Aspect-Based Sentiment Analysis Through Deep Learning Models

  Chen Li, Huidong Tang, Jinli Zhang, Xiujing Guo, Debo Cheng, Yasuhiko Morimoto

  Lecture Notes in Computer Science 228-242 2024年12月14日 査読有り筆頭著者責任著者
• When Molecular GAN Meets Byte-Pair Encoding

  Huidong Tang, Chen Li, Yasuhiko Morimoto

  Lecture Notes in Computer Science 160-174 2024年12月13日 責任著者
• Tailored Federated Learning: Leveraging Direction Regulation and Knowledge Distillation

  Huidong Tang, Chen Li, Huachong Yu, Sayaka Kamei, Yasuhiko Morimoto

  Lecture Notes in Computer Science 270-284 2024年12月13日 責任著者
• Mining area skyline objects from map-based big data using Apache Spark framework

  Chen Li, Ye Zhu, Yang Cao, Jinli Zhang, Annisa Annisa, Debo Cheng, Yasuhiko Morimoto

  Array 2024年12月 筆頭著者

MISC

• 深層学習のソフトウェア信頼性とサイバーセキュリティへの応用

  李晨, 鄭俊俊

  オペレーションズ・リサーチ 68(5) 250-258 2023年5月 査読有り招待有り筆頭著者
• APIコールを用いたTransformer Encoderベースマルウェア分類に関する考察

  LI Chen, ZHENG Junjun

  電子情報通信学会技術研究報告(Web) 122(203(R2022 32-39)) 2022年

講演・口頭発表等

• 生成AIによる知的分子設計と創薬への応用

  李晨

  京都大学 2026年8月21日 招待有り
• Advancing Molecular Design with Generative AI

  Chen Li

  Huazhong Agricultural University 招待有り
• Molecular generation with Generative AI: Model Design and Applications

  Chen Li

  South China Normal University
• 生成AIを活用した創薬への応用

  李晨

  世界人工知能大会(WAIC) 2025年7月27日 招待有り
• 深層学習による遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた創薬標的分子の予測と希少疾患への応用

  難波里子, 李晨, 大谷則子, 山西芳裕

  日本薬学会第145回 2025年3月26日
• 遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた半教師あり深層学習による治療標的分子の予測と希少疾患への応用

  難波里子, 李晨, 大谷則子, 山西芳裕

  第130回 日本解剖学会/第102回 日本生理学会/第98回 日本薬理学会合同大会 2025年3月17日
• Transformer GANを用いた化学特性の最適化を目指した分子生成 [in Japanese] (Transformer GAN-based molecular generation with property optimization

  Chen Li

  the 455th Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2024年5月 招待有り
• Transformer GANを用いた化学特性の最適化を目指した分子生成

  Chen Li

  The 455th Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2024年
• Gene Expression Data-Driven Scaffold-Constrained Molecular Structure Generation by Deep Neural Network

  Matsukiyo, Y., Yamanaka, C., Li, C., Yamanishi, Y.

  The 8th Autumn School of Chemoinformatics in Nara 2023 (HP) 2023年11月28日
• Transformer Encoder-based Generative Adversarial Network for Design of Polypharmacological Drugs

  安田花純, 李晨, 海東和麻, 山西芳裕

  情報計算化学生物学会(CBI学会) 2023年10月23日
• Scaffold-retained transformer GAN for molecular generation with chemical property optimizatio

  C. Li, Y. Yamanishi

  情報計算化学生物学会(CBI学会) 2023年10月
• Moving beyond traditional anomaly detection

  Chen Li

  the 27th Pacific-Asia Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (PAKDD 2023) 2023年
• Molecular generation using sequence-based transformer generative adversarial network

  Chen Li, Yoshihiro Yamanishi

  2022年10月
• Transformer-based generative adversarial networks for generating molecules with desired properties

  Chen Li, Kazuma Kaitoh, Yoshihiro Yamanishi

  Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2021年10月
• AI model development and its application in drug discover

  Chen Li

  Beijing Institute of Technology 2020年
• 細胞応答情報を考慮した再帰型ニューラルネットワークによる標的タンパク質に対するリガンド生成

  松清優樹, 天花寺厚, 李晨, 山西芳裕

  第47回ケモインフォマティクス討論会

担当経験のある科目(授業)

• 2026年4月 - 現在

  マルチメディア工学演習I (大阪大学 情報科学研究科)
• 2026年4月 - 現在

  マルチメディアシステムアーキテクチャ (大阪大学 情報科学研究科)
• 2025年4月 - 2025年8月

  マルチメディア工学演習I (大阪大学 情報科学研究科)
• 2025年4月 - 2025年8月

  マルチメディアシステムアーキテクチャ (大阪大学 情報科学研究科)

所属学協会

• 2025年12月 - 現在

  米国電気電子学会(IEEE)
• 2025年12月 - 現在

  日本データベース学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

• 情報統合型生成AIによる精密医療向け分子設計

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究 若手研究 2026年4月 - 2029年3月

  李 晨
• AIを用いた構造―励起状態相関解析に基づく未踏二光子励起蛍光体の創製

  大阪大学D3センター D3 センター 学際共創プロジェクト 2026年8月 - 2027年3月

  有澤光弘, 李晨
• 生成AIは学術的信頼性を脅かすのか?―人文社会系国際ジャーナルにおける幻覚引用の実態解明―

  大阪大学D3センター D3 センター 学際共創プロジェクト 2026年8月 - 2027年3月

  李明, 李晨, 程飛
• 生成 AI 技術を用いた安定的かつ多目的分子設計フレームワークの開発

  大阪大学D3センター D3 センター 学際共創プロジェクト 2025年8月 - 2026年3月

  李晨
• 純粋なトランスフォーマーを用いた敵対的生成ネットワークによる医薬分子構造生成

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 2023年4月 - 2025年1月

  山西 芳裕, LI CHEN