歐陽 允健

基本情報

所属

国際基督教大学 教養学部アーツ・サイエンス学科 助教

学位

博士(医学)(2019年5月 九州大学)

研究者番号

40906351

ORCID iD

https://orcid.org/0000-0002-0312-1073

J-GLOBAL ID

202101017126252793

researchmap会員ID

R000026330

外部リンク

https://subsites.icu.ac.jp/people/auyeung.genome/

研究キーワード

• 生殖細胞
• 第3世代シーケンシング
• ゲノム生物学
• 機械学習
• 長鎖シーケンサー
• 次世代シーケンサー
• エピジェネティクス

研究分野

• ライフサイエンス / 発生生物学 / 発生生物学
• ライフサイエンス / ゲノム生物学 / ゲノム生物学関連
• 情報通信 / 数理情報学 / 機械学習
• ライフサイエンス / ゲノム生物学 / 長鎖シーケンサー
• ライフサイエンス / ゲノム生物学 / 次世代シーケンサー
• ライフサイエンス / 発生生物学 / 生殖細胞、初期胚

経歴

• 2024年4月 - 2029年3月

  国際基督教大学, 教養学部 アーツ・サイエンス学科, 助教
• 2023年4月 - 2024年3月

  九州大学生体防御医学研究所, 助教 (特任助教)
• 2022年4月 - 2023年3月

  九州大学生体防御医学研究所, 助教 (特定プロジェクト 教員・助教)
• 2021年4月 - 2022年3月

  九州大学生体防御医学研究所, 助教 (特任助教)
• 2019年6月 - 2021年3月

  九州大学生体防御医学研究所 (学術研究員)

学歴

• 2014年4月 - 2019年5月

  九州大学, 医学系学府, 医学専攻
• 2008年8月 - 2011年12月

  The Chinese University of Hong Kong

受賞

• 2026年6月

  日本エピジェネティクス研究会奨励賞, 日本エピジェネティクス研究会
• 2013年4月

  日本政府(文部科学省)奨学金留学生, 文部科学省

論文

• Recent advances in methodologies of epigenomics

  Hiroaki Ohishi, Wan Kin Au Yeung

  Epigenomics 1-19 2025年11月3日 査読有り最終著者
• A deletion at the X-linked ARHGAP36 gene locus is associated with the orange coloration of tortoiseshell and calico cats

  Hidehiro Toh, Wan Kin Au Yeung, Motoko Unoki, Yuki Matsumoto, Yuka Miki, Yumiko Matsumura, Yoshihiro Baba, Takashi Sado, Yasukazu Nakamura, Miho Matsuda …

  Current Biology 2025年5月 査読有り筆頭著者
• DPPA3 facilitates genome-wide DNA demethylation in mouse primordial germ cells

  Keisuke Toriyama, Wan Kin Au Yeung, Azusa Inoue, Kazuki Kurimoto, Yukihiro Yabuta, Mitinori Saitou, Toshinobu Nakamura, Toru Nakano, Hiroyuki Sasaki

  BMC Genomics 25(1) 2024年4月5日 査読有り責任著者
• The DNMT3A ADD domain is required for efficient de novo DNA methylation and maternal imprinting in mouse oocytes

  Ryuji Uehara, Wan Kin Au Yeung, Keisuke Toriyama, Hiroaki Ohishi, Naoki Kubo, Hidehiro Toh, Isao Suetake, Kenjiro Shirane, Hiroyuki Sasaki

  PLOS Genetics 19(8) e1010855-e1010855 2023年8月1日 査読有り
• Novel compound heterozygous mutations in UHRF1 are associated with atypical immunodeficiency, centromeric instability, and facial anomalies (ICF) syndrome with distinctive genome-wide DNA hypomethylation.

  Motoko Unoki, Guillaume Velasco, Satomi Kori, Kyohei Arita, Yasukazu Daigaku, Wan Kin Au Yeung, Akihiro Fujimoto, Hirofumi Ohashi, Takeo Kubota, Kunio Miyake …

  Human molecular genetics 32(9) 1439-1456 2022年12月2日 査読有り
• CMIC: predicting DNA methylation inheritance of CpG islands with embedding vectors of variable-length k-mers.

  Osamu Maruyama, Yinuo Li, Hiroki Narita, Hidehiro Toh, Wan Kin Au Yeung, Hiroyuki Sasaki

  BMC bioinformatics 23(1) 371-371 2022年9月12日 査読有り責任著者
• Low Input Genome-Wide DNA Methylation Analysis with Minimal Library Amplification

  Wan Kin Au Yeung, Hiroyuki Sasaki

  2022年7月8日 査読有り
• Production of functional oocytes requires maternally expressed PIWI genes and piRNAs in golden hamsters

  Hidetoshi Hasuwa, Yuka W. Iwasaki, Wan Kin Au Yeung, Kyoko Ishino, Harumi Masuda, Hiroyuki Sasaki, Haruhiko Siomi

  Nature Cell Biology 2021年9月6日 査読有り
• A convolutional neural network-based regression model to infer the epigenetic crosstalk responsible for CG methylation patterns.

  Wan Kin Au Yeung, Osamu Maruyama, Hiroyuki Sasaki

  BMC bioinformatics 22(1) 341-341 2021年6月23日 査読有り筆頭著者責任著者
• Reprogramming of the histone H3.3 landscape in the early mouse embryo.

  Takashi Ishiuchi, Shusaku Abe, Kimiko Inoue, Wan Kin Au Yeung, Yuka Miki, Atsuo Ogura, Hiroyuki Sasaki

  Nature structural & molecular biology 28(1) 38-49 2021年1月 査読有り
• A Rice Immunophilin Homolog, OsFKBP12, Is a Negative Regulator of Both Biotic and Abiotic Stress Responses.

  Ming-Yan Cheung, Wan-Kin Auyeung, Kwan-Pok Li, Hon-Ming Lam

  International journal of molecular sciences 21(22) 2020年11月20日 査読有り
• Maternal DNMT3A-dependent de novo methylation of the paternal genome inhibits gene expression in the early embryo.

  Julien Richard Albert, Wan Kin Au Yeung, Keisuke Toriyama, Hisato Kobayashi, Ryutaro Hirasawa, Julie Brind'Amour, Aaron Bogutz, Hiroyuki Sasaki, Matthew Lorincz

  Nature communications 11(1) 5417-5417 2020年10月27日 査読有り
• Polycomb Group Proteins Regulate Chromatin Architecture in Mouse Oocytes and Early Embryos.

  Zhenhai Du, Hui Zheng, Yumiko K Kawamura, Ke Zhang, Johanna Gassler, Sean Powell, Qianhua Xu, Zili Lin, Kai Xu, Qian Zhou …

  Molecular cell 77(4) 825-839 2020年2月20日 査読有り
• Characterization of genetic-origin-dependent monoallelic expression in mouse embryonic stem cells.

  Hiroaki Ohishi, Wan Kin Au Yeung, Motoko Unoki, Kenji Ichiyanagi, Kei Fukuda, Shoji Maenohara, Kenjiro Shirane, Hatsune Chiba, Takashi Sado, Hiroyuki Sasaki

  Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 25(1) 54-64 2020年1月 査読有り筆頭著者
• Histone H3K9 Methyltransferase G9a in Oocytes Is Essential for Preimplantation Development but Dispensable for CG Methylation Protection.

  Wan Kin Au Yeung, Julie Brind'Amour, Yu Hatano, Kazuo Yamagata, Robert Feil, Matthew C Lorincz, Makoto Tachibana, Yoichi Shinkai, Hiroyuki Sasaki

  Cell reports 27(1) 282-293 2019年4月2日 査読有り筆頭著者
• Drought Stress and Tolerance in Soybean

  Yee Shan Ku, Wan Kin Au Yeung, Yuk Lin Yung, Man Wah Li, Chaoqing Wen, Xueyi Liu, Hon Ming Lam

  2013年1月2日 査読有り
• The GCN2 homologue in Arabidopsis thaliana interacts with uncharged tRNA and uses Arabidopsis eIF2α molecules as direct substrates.

  M-W Li, W-K AuYeung, H-M Lam

  Plant biology (Stuttgart, Germany) 15(1) 13-8 2013年1月 査読有り

MISC

• イエネコオレンジ遺伝子の雌に特異的なランダム不活性化

  松田美穂, 藤英博, 歐陽允健, 鵜木元香, 松本悠貴, 松村友美子, 佐渡敬, 中村保一, 佐々木裕之

  日本遺伝学会大会プログラム要旨集(CD-ROM) 97th 2025年
• 哺乳類卵子の新規DNAメチル化制御におけるDPPA3の役割

  歐陽允健, 歐陽允健, 大石裕晃, 鳥山敬祐, 井上梓, 中村肇伸, 仲野徹, 佐々木裕之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年

講演・口頭発表等

• Estimating the dynamics of chromatin structure via integrated machine learning

  Wan Kin Au Yeung

  EMBO 25th Young Investigator Network Annual Meeting 2026年3月12日 招待有り
• 機械学習を融合したクロマチン構造変化の推定

  歐陽允健

  さきがけ「高次構造体」・ACT-X「生命と情報」合同公開シンポジウム 「若い知性が開拓する新しい生命科学」 2026年2月13日 招待有り
• Role of DPPA3 in regulating de novo DNA methylation in mammalian oocytes

  The 47th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2024年11月
• DPPA3 facilitates genome-wide DNA demethylation in mouse primordial germ cells

  The 46th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2023年12月
• In silico screening for DNA methylation regulatory sequences within CpG islands in embryos

  The 95th Annual Meeting of the Genetics Society of Japan 2023年9月
• In silico screening for DNA methylation regulatory sequences within CpG islands in embryos

  The 16th Annual Meeting of the Japanese Society for Epigenetics 2023年6月
• Stella facilitates genome-wide passive DNA demethylation in mouse primordial germ cells

  The 64th Annual Meeting of Japan Society for Ova Research 2023年5月
• Stella contributes to CG methylation reprogramming in mouse primordial germ cells

  The 45th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2022年11月
• Stella contributes to CG methylation reprogramming in mouse primordial germ cells

  Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) 2022 Meeting on Epigenetics & Chromatin 2022年9月
• Stella contributes to CG methylation reprogramming in mouse primordial germ cells

  The 94th Annual Meeting of the Genetics Society of Japan 2022年9月
• Stella facilitates CG methylation reprogramming downstream of Prdm14 during germ cell development

  The 15th Annual Meeting of the Japanese Society for Epigenetics 2022年6月
• 母体因子Stellaと生殖細胞のDNAメチル化

  歐陽允健

  2022 遺伝研研究会 有性生殖における染色体・クロマチン・核動態に関する若手研究者の会 2022年4月14日 招待有り
• A convolutional neural network-based regression model to infer the epigenetic crosstalk responsible for CG methylation patterns

  The 44th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2021年12月
• A machine learning model to infer the epigenetic crosstalk responsible for CG methylation patterns

  The 93th Annual Meeting of the Genetics Society of Japan 2021年9月
• A convolutional neural network-based regression model to infer the epigenetic crosstalk responsible for CG methylation patterns

  The 2021 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics 2021年9月
• A convolutional neural network-based regression model to infer the epigenetic crosstalk responsible for CG methylation patterns

  The 14th Annual Meeting of the Japanese Society for Epigenetics 2021年5月
• Machine learning captures epigenetic crosstalk associated with CG methylation in mammalian oocytes

  The 43rd Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2020年12月
• Deep learning captures epigenetic crosstalk associated with CG methylation in mammalian oocytes

  Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) 2020 Meeting on Epigenetics & Chromatin 2020年9月
• Analyzing CG methylation in oocytes using deep learning

  The 2020 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics 2020年9月
• Histone H3K9 methyltransferase G9a in oocyte is essential for preimplantation development but dispensable for CG methylation protection

  The 42nd Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2019年12月

担当経験のある科目(授業)

• 2025年 - 現在

  BIO214 生物統計学 (国際基督教大学)
• 2024年 - 現在

  QALL401 研究者のためのデータ活用と分析 (国際基督教大学)
• 2024年 - 現在

  BIO316 情報生物学演習 (国際基督教大学)
• 2024年 - 現在

  BIO252 生物学実習 (国際基督教大学)
• 2024年 - 現在

  BIO103 基礎生物学実習 (国際基督教大学)
• 2024年 - 現在

  GEN001 N1:生命科学 (国際基督教大学)
• 2024年 - 現在

  BIO381 生物学特別演習 I (国際基督教大学)
• 2024年 - 現在

  BIO317 生物工学 (国際基督教大学)
• 2024年 - 現在

  BIO101 基礎生物学 (国際基督教大学)

所属学協会

• 2015年 - 現在

  日本分子生物学会
• 2017年 - 現在

  日本エピジェネティクス研究会
• 2019年 - 現在

  日本バイオインフォマティクス学会
• 2019年8月

  日本遺伝学会
• 2021年 - 現在

  日本遺伝学会
• 2023年 - 現在

  日本卵子学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

• 機械学習を融合したクロマチン構造変化の推定

  科学技術振興機構 (JST) 戦略的創造研究推進事業 ACT-X 2024年10月 - 2027年3月

  歐陽 允健
• 機械学習を融合したクロマチン構造変化の推定

  科学技術振興機構 戦略的な研究開発の推進/戦略的創造研究推進事業/ACT-X 2024年 - 2026年

  歐陽 允健
• 哺乳類卵子と初期胚の5-ヒドロキシメチルシトシンの制御機構解明

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究 2023年4月 - 2025年3月

  歐陽 允健
• ロングリード全ゲノム微量解析法開発によるDNAヒドロキシメチル化の機能解明

  持田記念医学薬学振興財団 研究助成金 2023年12月 - 2024年12月

  歐陽 允健
• 卵子と受精卵におけるDNAヒドロキシメチル化の網羅的解析

  ヒロセ財団 第 8 回研究助成 2021年12月 - 2024年3月

  歐陽 允健