堀 孝一

基本情報

所属

東京科学大学 生命理工学院 研究員

研究者番号

70453967

J-GLOBAL ID

201601021305869857

researchmap会員ID

7000018068

研究分野

• ライフサイエンス / 植物分子、生理科学 /
• ライフサイエンス / 機能生物化学 /
• ライフサイエンス / 進化生物学 /

経歴

• 2024年4月 - 現在

  東京工業大学, 生命理工学院, 研究員
• 2016年4月 - 2024年3月

  東京工業大学, 生命理工学院, 助教
• 2014年2月 - 2016年3月

  東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 産学官連携研究員
• 2010年2月 - 2014年1月

  東京工業大学, 生命理工学研究科, グローバルCOE研究員
• 2006年4月 - 2010年2月

  立教大学, 理学部 (ポストドクトラルフェロー)
• 2004年4月 - 2006年3月

  独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員
• 2000年1月 - 2000年3月

  昭和大学, 薬学部 生物化学 (実験補助員)
• 1998年4月 - 1999年4月

  株式会社 住友金属バイオサイエンス

学歴

• 2002年4月 - 2005年3月

  東京大学, 大学院総合文化研究科, 広域科学専攻 博士課程
• 2000年4月 - 2002年3月

  東京大学, 大学院総合文化研究科, 広域科学専攻 修士課程
• 1994年4月 - 1998年3月

  横浜国立大学, 教育学部, 基礎理学課程

受賞

• 手島精一記念研究賞 研究論文賞, Klebsormidium flaccidum genome reveals primary factors for plant terrestrial adaptation, 東京工業大学

論文

• Knockout of an SPX-related gene for polyphosphate synthetase accelerates phosphate-starvation responses in the oleaginous microalga Nannochloropsis oceanica

  Kumiko Okazaki, Koichi Hori, Masako Iwai, Tomokazu Kurita, Shinsuke Shimizu, Seiji Nomura, Fumihiko Saito, Shinichiro Maeda, Akihide Takami, Takashi Yamamoto …

  Journal of Experimental Botany 2025年4月23日
• Sulfide-responsive transcription control inEscherichia coli

  Koichi Hori, Rajalakshmi Balasubramanian, Shinji Masuda

  2024年11月5日 筆頭著者
• Monitoring sodium caseinate and whey protein isolate interaction with mild preheat treatment using ultrasound spectroscopy and confocal laser scanning microscopy

  Naoko Yuno-Ohta, Yuuka Hoshi, Mashiro Shimazaki, Hiroyuki Ohta, Koichi Hori

  Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 241 114016-114016 2024年9月 査読有り
• SENSITIVE TO FREEZING2 is crucial for growth of Marchantia polymorpha under acidic conditions

  Shinsuke Shimizu, Koichi Hori, Kimitsune Ishizaki, Hiroyuki Ohta, Mie Shimojima

  Journal of Plant Research 2024年8月4日
• Phosphatidic acid phosphohydrolase modulates glycerolipid synthesis in Marchantia polymorpha and is crucial for growth under both nutrient-replete and -deficient conditions

  Misao Shimojo, Masashi Nakamura, Ginga Kitaura, Yuta Ihara, Shinsuke Shimizu, Koichi Hori, Masako Iwai, Hiroyuki Ohta, Kimitsune Ishizaki, Mie Shimojima

  Planta 258(5) 92 2023年10月4日 査読有り
• Cis-regulatory elements and transcription factors related to auxin signaling in the streptophyte algae Klebsormidium nitens

  Noriaki Tounosu, Kanami Sesoko, Koichi Hori, Mie Shimojima, Hiroyuki Ohta

  Scientific Reports 13(1) 2023年6月15日 査読有り責任著者
• The Sulfide-Responsive SqrR/BigR Homologous Regulator YgaV of Escherichia coli Controls Expression of Anaerobic Respiratory Genes and Antibiotic Tolerance

  Rajalakshmi Balasubramanian, Koichi Hori, Takayuki Shimizu, Shingo Kasamatsu, Kae Okamura, Kan Tanaka, Hideshi Ihara, Shinji Masuda

  Antioxidants 11(12) 2022年11月28日 査読有り
• Characterization of the gelation and resulting network of a mixed-protein gel derived from sodium caseinate and ovalbumin in the presence of glucono-δ-lactone.

  Yuno-Ohta N, Shimonomura N, Hoshi Y, Leocmach M, Hori K, Ohta H

  Colloids and surfaces. B, Biointerfaces 198 111472-111472 2020年11月 査読有り
• MYB-like transcription factor NoPSR1 is crucial for membrane lipid remodeling under phosphate starvation in the oleaginous microalga Nannochloropsis oceanica.

  Murakami H, Kakutani N, Kuroyanagi Y, Iwai M, Hori K, Shimojima M, Ohta H

  FEBS letters 2020年8月 査読有り
• Lipid remodeling regulator 1 (LRL1) is differently involved in the phosphorus-depletion response from PSR1 in Chlamydomonas reinhardtii.

  Hidayati NA, Yamada-Oshima Y, Iwai M, Yamano T, Kajikawa M, Sakurai N, Suda K, Sesoko K, Hori K, Obayashi T …

  The Plant journal : for cell and molecular biology 100(3) 610-626 2019年8月 査読有り
• SnRK2 protein kinases represent an ancient system in plants for adaptation to a terrestrial environment

  Akihisa Shinozawa, Ryoko Otake, Daisuke Takezawa, Taishi Umezawa, Kenji Komatsu, Keisuke Tanaka, Anna Amagai, Shinnosuke Ishikawa, Yurie Hara, Yasuko Kamisugi …

  Communications Biology 2(1) 2019年1月21日 査読有り
• Recurrent acquisition of cytosine methyltransferases into eukaryotic retrotransposons

  Alex de Mendoza, Amandine Bonnet, Dulce B. Vargas-Landin, Nanjing Ji, Hongfei Li, Feng Yang, Ling Li, Koichi Hori, Jahnvi Pflueger, Sam Buckberry …

  Nature Communications 9(1) 2018年4月9日 査読有り
• Betaine Lipid Is Crucial for Adapting to Low Temperature and Phosphate Deficiency in Nannochloropsis.

  Murakami H, Nobusawa T, Hori K, Shimojima M, Ohta H

  Plant physiology 177(1) 181-193 2018年3月 査読有り
• Differently localized lysophosphatidic acid acyltransferases crucial for triacylglycerol biosynthesis in the oleaginous alga Nannochloropsis.

  Nobusawa T, Hori K, Mori H, Kurokawa K, Ohta H

  2017年5月 査読有り
• Primitive Auxin Response without TIR1 and Aux/IAA in the Charophyte Alga Klebsormidium nitens.

  Ohtaka K, Hori K, Kanno Y, Seo M, Ohta H

  Plant physiology 174(3) 1621-1632 2017年5月 査読有り
• Genetics of the Blue Light-Dependent Signal Cascade That Controls Phototaxis in the Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC6803.

  Sugimoto Y, Nakamura H, Ren S, Hori K, Masuda S

  2017年3月 査読有り
• Sulfide-responsive transcriptional repressor SqrR functions as a master regulator of sulfide-dependent photosynthesis.

  Shimizu T, Shen J, Fang M, Zhang Y, Hori K, Trinidad JC, Bauer CE, Giedroc DP, Masuda S

  2017年2月 査読有り
• Tangled evolutionary processes with commonality and diversity in plastidial glycolipid synthesis in photosynthetic organisms.

  Hori K, Nobusawa T, Watanabe T, Madoka Y, Suzuki H, Shibata D, Shimojima M, Ohta H

  Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids 1861(9) 1294-1308 2016年9月 査読有り筆頭著者
• Eukaryotic Components Remodeled Chloroplast Nucleoid Organization during the Green Plant Evolution.

  Kobayashi Y, Takusagawa M, Harada N, Fukao Y, Yamaoka S, Kohchi T, Hori K, Ohta H, Shikanai T, Nishimura Y

  Genome Biology and Evolution 8(1) 1-16 2016年1月 査読有り
• Primitive Extracellular Lipid Components on the Surface of the Charophytic Alga Klebsormidium flaccidum and Their Possible Biosynthetic Pathways as Deduced from the Genome Sequence.

  Kondo S, Hori K, Sasaki-Sekimoto Y, Kobayashi A, Kato T, Yuno-Ohta N, Nobusawa T, Ohtaka K, Shimojima M, Ohta H

  Frontiers in Plant Science 7 2016年 査読有り

MISC

• TALENを介したポリリン酸合成酵素とリパーゼの遺伝子編集は油脂高生産藻ナンノクロロプシスにおいてリン欠乏下の油脂蓄積を増大させる

  岡崎久美子, 岩井雅子, 栗田朋和, 堀孝一, 下嶋美恵, 前田真一郎, 高見明秀, 山本卓, 山本卓, 太田啓之 …

  日本植物生理学会年会(Web) 66th 2025年
• Context analysis of termination Codons in mRNA that are recognized by plant NMD (vol 48, pg 1072, 2007)

  Koichi Hori, Yuichiro Watanabe

  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 48(9) 1391-1391 2007年9月
• The NMD system influences mRNA primary sequences through genome evolution

  Koichi Hori, Yuichiro Watanabe

  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 48 S11-S11 2007年
• Global analysis of targets of NMD in Arabidopsis

  Masato Yoine, Maya Akahori, Koichi Hori, Yuichiro Watanabe, Kenzo Nakamura

  PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 48 S11-S11 2007年
• (355) トマト(GCR267)の抵抗性遺伝子Tm-2^2の機能解析(平成17年度日本植物病理学会大会講演要旨)

  大窪 恵美子, 岡村 仁美, 滝澤 真理, 堀 孝一, 渡辺 雄一郎

  日本植物病理學會報 71(3) 280-280 2005年8月25日

書籍等出版物

• 植物科学最前線 7:65

  堀孝一、太田啓之 (担当:共著, 範囲:車軸藻クレブソルミディウムのゲノムから見た植物の陸上化)

  2016年
• 無敵のバイオテクニカルシリーズRNA実験ノート(下)第3章 RNAiを用いた応用解析 5節, 羊土社, p118-125

  堀孝一、渡辺雄一郎 (担当:共著, 範囲:RNAiの植物への応用)

  2009年
• Method in Enzymology 449, 165-176.

  Hori K, Watanabe Y (担当:共著, 範囲:In vivo analysis of plant nonsense-mediated mRNA decay.)

  2009年 査読有り
• 蛋白質 核酸 酵素増刊, 共立出版, mRNAプログラム 多様性と非対称性の獲得戦略p.2189-2194

  堀孝一、渡辺雄一郎 (担当:共著, 範囲:植物のナンセンス変異依存mRNA分解(NMD))

  2008年
• RNAの細胞生物学 「蛋白質 核酸 酵素」増刊

  堀孝一, 栗原志夫, 渡辺雄一郎 (担当:共著, 範囲:植物での転写後サイレンシング(PTGS), p459-468)

  2003年

講演・口頭発表等

• クレブソルミディウムのオーキシン応答と乾燥ストレス応答 -陸上植物との共通と相違-

  堀 孝一,唐司 典明,瀬底 かなみ,三木 健,下嶋 美恵,太田 啓之

  日本植物学会第87回大会シンポジウム 2023年9月8日 招待有り
• 植物の陸上進出と乾燥ストレス応答機構の発達

  堀孝一

  第12回日本光合成学会シンポジウム 2022年5月20日 招待有り
• 車軸藻類クレブソルミディウムにおけるリン欠乏応答とグルクロノシルジアシルグリセロール合成酵素の解析

  関根伸輔, 堀孝一, 唐司典明, 井原雄太, 清水信介, 下嶋美惠, 太田啓之

  第18回植物脂質シンポジウム 2021年9月21日
• 車軸藻類クレブソルミディウムの乾燥応答に関与する転写因子の解析

  堀孝一,唐司典明,瀬底かなみ,下嶋美恵,太田啓之

  第61回日本植物生理学会年会 2020年
• 車軸藻類クレブソルミディウムの乾燥・沈水応答に関与する転写因子の解析

  堀孝一,唐司典明,瀬底かなみ,下嶋美恵,太田啓之

  日本植物学会第84回大会 2020年
• 車軸藻類クレブソルミディウムのAREB様bZIP転写因子は水ストレスの共通制御因子として働く

  堀孝一, 唐司典明, 瀬底かなみ, 下嶋美恵, 太田啓之

  第62回日本植物生理学会年会 2020年
• 車軸藻クレブソルミディウムの気相,液相培養によるトランスクリプトーム解析

  堀孝一,太田啓之

  第58回日本植物生理学会年会 2017年
• Comparative transcriptome analysis of Klebsormidium nitens NIES-2285 between solid and liquid culture.

  Hori K and Ohta H

  XIX International Botanical Congress 2017年
• Revision of Klebsormidium flaccidum Gene models (version 1.1)

  Hori K, Umetsu J, Mori H, Kurokawa K and Ohta H

  EMBO workshop : New model systems for early land plant evolution (w16-05) Vienna 2016年
• 植物の陸上進出と遺伝子発現ネットワークの変遷

  堀孝一

  第5回植物RNA研究ネットワークシンポジウム 2015年 招待有り
• The Klebsormidium Genome

  Hori K, Kondo S, Ohtaka K, Tounosu N, Watanabe T, Kurokawa K, Ohta H

  International Plant & Animal Genome XXIII 2015年 招待有り
• 車軸藻植物門クレブソルミディウムの気相への環境応答

  堀孝一, 近藤智, 唐司 典明, 大高きぬ香, 渡邊 汀, 太田啓之

  日本植物学会第79回大会 2015年
• 車軸藻植物門クレブソルミディウムのゲノム解読と他植物との比較解析

  堀孝一, 山本希, 梅津純平, 富樫智章, 円由香, 下嶋美恵, 瀬尾光範, 近藤智, 大高きぬ香, 唐司 典明, 渡邊 汀, 東光一, 森宙史, 山田拓司, 増田真二, 黒川顕, 太田啓之

  第55回日本植物生理学会年会 2014年
• ゲノムデータに基づくオルガネラ移行シグナル配列の獲得過程の予測

  堀孝一, 近藤智, 大高きぬ香, 唐司典明, 渡邊汀, 黒川顕, 太田啓之

  日本植物学会第78回大会シンポジウム「古い酒を新しい革袋に〜preexisting gene regulatory networkの転用による陸上植物のボディプラン革新」 2014年 招待有り
• 車軸藻綱クレブソルミディウムのゲノム解析と植物の陸上化要因の予測

  堀孝一, .. (41名略)..., 柴田大輔, 神谷勇治, 佐藤直樹, 中村保一, 田畑哲之, 井田茂, 黒川顕, 太田啓之

  第54回日本植物生理学会年会 2013年
• 車軸藻植物門クレブソルミディウムのゲノム解析と脂質代謝系の進化過程の解析

  堀孝一, .. (41名略)..., 柴田大輔, 神谷勇治, 佐藤直樹, 中村保一, 田畑哲之, 井田茂, 黒川顕, 太田啓之

  日本植物学会第77回大会 2013年
• 車軸藻植物門クレブソルミディウムのゲノム解析から見た植物の陸上進出

  堀孝一

  第9回光合成若手の会 2013年 招待有り
• 気生藻類クレブソルミディウムの環境変化に対する光合成応答の解析

  堀孝一、丸山史人、佐藤修正、下嶋美恵、増田真二、佐藤直樹、田畑哲之、黒川顕、太田啓之

  第53回日本植物生理学会年会 2012年
• 車軸藻綱クレブソルミディウムのオルガネラDNA配列から予測される植物の陸上化要因

  堀孝一、丸山史人、佐藤修正、下嶋美恵、増田真二、佐藤直樹、田畑哲之、黒川顕、太田啓之

  第52回日本植物生理学会年会 2011年
• 車軸藻綱クレブソルミディウムのオルガネラDNAの解析と植物の陸上化要因の予測

  堀孝一、丸山史人、佐藤修正、下嶋美恵、増田真二、佐藤直樹、田畑哲之、黒川顕、太田啓之

  日本植物学会第75回大会 2011年

担当経験のある科目(授業)

• 2017年 - 現在

  生命理工学基礎実験・演習第三 A,B,C,D 分担 (東京工業大学)
• 2019年 - 2019年

  生命理工学特別講義3 各年で1日 分担 (東京工業大学)

所属学協会

• 日本植物学会
• 日本植物生理学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

• 車軸藻類クレブソルミディウムを用いた、植物の乾燥ストレス情報伝達経路の起源の解明

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

  堀孝一
• 複合系食品ゲルの構造観察と超音波分光分析を用いた物性発現機構の解明

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

  太田 尚子, 堀 孝一
• 光合成生物に広く保存された栄養欠乏時の脂質転換制御とその応用の分子基盤

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(A) 基盤研究(A) 2018年4月 - 2023年3月

  太田 啓之, 増田 建, 西村 浩二, 小林 康一, 堀 孝一, 粟井 光一郎, 下嶋 美恵, 清水 隆之
• クレブソルミディウムのTIR1を介さないオーキシン応答を誘導する転写因子の探索

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

  堀 孝一
• ゲノムと表層脂質の解析から分かった車軸藻ワックスの存在と陸上環境適応における意義

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

  太田 啓之, 堀 孝一, 佐々木 結子
• 葉緑体特異的リボソームタンパク質による葉緑体翻訳調節機構の解析

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究(スタートアップ) 若手研究(スタートアップ) 2007年 - 2008年

  堀 孝一
• 植物の発生、抵抗性反応におけるNMDの機能に関する解析

  日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 特別研究員奨励費 2004年 - 2005年

  堀 孝一

産業財産権

• 特開2021-078379 Δ4デサチュレースによるドコサヘキサエン酸合成

  太田 啓之, 永井 千夏, 下嶋 美恵, 岩井 雅子, 堀 孝一, 佐々木 結子
• 特開2019-216643 脂質の製造方法

  太田 啓之, 下嶋 美恵, 信澤 岳, 堀 孝一, 佐々木 結子, 岩井 雅子, 永井 千夏
• 特願2019-014800 微生物及びトリアシルグリセロールの製造方法

  坂本敦, 岡崎久美子, 山本卓, 太田啓之, 堀孝一, 清水信介, 高見明秀, 野村誠治, 斉藤史彦
• 特願2016-506427 β-ケトアシル-ACPシンターゼを用いた脂質の製造方法

  杉原 慎二, 尾崎 達郎, 遠藤 寛子, 斎藤 猛, 東條 卓人, 太田 啓之, 堀 孝一
• 特許第6381139号 アシル-ACPチオエステラーゼ

  尾崎 達郎, 太田 啓之, 堀 孝一

学術貢献活動

• 第12回日本光合成学会年会およびシンポジウム 世話人メンバー

  その他

  日本光合成学会 2022年
• The 23rd International Symposium on Plant Lipids (ISPL2018) 大会準備委員

  その他

  植物脂質研究会 2018年7月
• 日本進化学会第18回大会委員会 大会準備委員

  その他

  日本進化学会 2016年8月
• 日本植物学会台78回大会 大会実行委員会 実行委員

  その他

  日本植物学会 2014年9月

社会貢献活動

• 神奈川県立厚木高等学校 高校生実験教室

  その他

  2015年 - 2021年