データベース全般
info 名称の読み方 ティーエムファンクション
info 別名 Functional Database of Membrane Proteins
info 作成者
作成者氏名:
グロミハ マイケル*
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info 連絡先 Dr. M. MICHAEL GROMIHA
Associate Professor
Department of Biotechnology
IIT Madras
Chennai - 600 036
Tel: +91-44-2257-4138(O)
tmfunction address
info データベース分類 構造データベース-タンパク質構造
info データベースの説明 TMFunctionは、α-ヘリックス及びβ-バレル型膜タンパク質に含まれる機能的残基のデータベースです。各タンパク質の名称と由来はUniProtで同定していますが、PDBとも関連づけられるものは、そのIDを示しています。このデータベースには様々な実験手法やパラメータ(例えば、"affinity", "dissociation constant", "IC50", "activity"など)が含まれています。また、タンパク質中の各残基(またはその変異)には、計算または実験によって得られた数値が付与されています。このデータベースで用いた実験データは、ジャーナルの調査及びPubMedのキーワード検索によって得られた文献から収集したものです。さらに完全な参照情報(ジャーナルの引用とPubMed ID)も、このデータベースには含まれています。
info データベースの特長・有用性・活用方法 TMFuoctionは、配列データベース(UniProt)、立体構造データベース(PDB)、文献データベース(PubMed)を橋渡ししています。
info データベースの利用許諾 CC 表示-継承
詳細
info 予算的背景・プロジェクト -
info 論文等
文献名:
TMFunction: database for functional residues in membrane proteins.
著者名:
Gromiha MM, Yabuki Y, Suresh MX, Thangakani AM, Suwa M, Fukui K.
雑誌名/掲載年月/号:
Nucleic Acids Res. 2009 Jan;37(Database issue)
外部リンク:
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データベースのオリジナルサイト情報
info オリジナルサイト (運用終了) http://tmbeta-genome.cbrc.jp/TMFunction/
info 運用開始年月日 2007/7
info 最終更新年月日 2008/9
info 統括サイト -
info データの一括ダウンロードサイト -
info 参照先データベース UniProt, PDB, PubMed
info 一覧表示 有り
info クエリ検索 有り
info Webサービス 無し
info WebサービスURL -
info ユーザ登録 無し