(Drug Search)サイト間相同性データ

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PoSSuM

info データ名

(Drug Search)サイト間相同性データ

info DOI

info データ内容の説明

(Drug Search)クエリサイトとターゲットサイトの中で、既知と未知の結合サイト間の相同性を示すデータです。

info データファイル

データファイル名:

possum_binding_sites_putative_similarity.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

5 MB

info 簡易検索URL

info データ取得方法

PDB

info 解析方法

info データ件数

113,495件

項目名	項目の説明
Q:PocketIndex	クエリサイトの内部ID
T:PocketIndex	ターゲットサイトの内部ID
Q:PDB_ID	クエリサイトのPDB ID
T:PDB_ID	ターゲットサイトのPDB ID
Q:HET_Code	クエリサイトのHETコード
T:HET_Code	ターゲットサイトのHETコード
Q:ChainID	クエリサイトのある鎖のID
T:ChainID	ターゲットサイトのある鎖のID
Q:Res.No.	クエリサイトのアミノ酸残基番号
T:Res.No.	ターゲットサイトのアミノ酸残基番号
AlignedLength	アミノ酸アライメント長
RMSD	平均二乗偏差
AminoIdentity	アミノ酸の一致率
Q:MolName	クエリの分子名
T:MolName	ターゲットの分子名
Q:EC	クエリのEC ID
T:EC	ターゲットのEC ID
Q:CATH	クエリのCATH ID
T:CATH	ターゲットのCATH ID
Q:SCOPe	クエリのSCOPe ID
T:SCOPe	ターゲットのSCOPe ID
Q:UniProt	クエリのUniProt ID
T:UniProt	ターゲットのUniProt ID
Q:UniRef50	クエリのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)
T:UniRef50	ターゲットのUniRef50クラスタID(解析当時のもの)
EC_Df	クエリとターゲットのEC IDの差異の有無
CATH_Df	クエリとターゲットのCATH IDの差異の有無
SCOPe_Df	クエリとターゲットのSCOPe IDの差異の有無
ChEMBL_Assay	ChEMBLのAssay情報の有無
AlignedResidues	アミノ酸残基アライメント結果

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