Re: .

Si elle parle effectivement d'alignement de séquences dont elle dispose, alors blast n'est pas une bonne solution. C'est un logiciel qui a été conçu pour aligner une séquence face à une base de données (par exemple celles du ncbi) en un temps raisonnable. L'algorithme utilise une heuristique très forte pour cela. S'il s'agit de réaliser une alignement multiple de séquences, il faut utiliser plutôt des outils tels que clustalW ou muscle. Le premier commence à dater et on fait mieux aujourd'hui, mais il reste le plus connu dans le monde de la biologie. Il me semble qu'il intègre une interface pour visualiser l'alignement.

Après, la requète à la base n'est pas très explicite... l'analyse de séquence c'est vaste !