ça passe très mal

Justement, Waf utilise pas mal de facteurs différents: lancement de processus, lecture de fichiers, analyse syntaxique (préprocesseur), programmation concurrente.

Pour le moment les profiles obtenus montrent que tout est plus lent que cPython, et pas seulement pour Waf:
http://psycle.svn.sourceforge.net/viewvc/psycle/branches/boh(...)

Note: l'utilisation des threads java n'améliore pas les performances.