• [^] # Re: Titre ramasse clic

    Posté par (Mastodon) . En réponse au lien Conda et le piège de la licence Anaconda. Évalué à 3. Dernière modification le 13 février 2025 à 11:21.

    En suivant le premier lien du texte en question on tombe sur le paragraphe suivant, qui décrit la différence avec pypi.

    Conda est un package manager écrit en python, comme pypi. Mais contrairement à celui-ci, il permet d'installer des programmes écrits dans d'autres langages. Notamment vos outils bioinformatiques préférés par l’intermédiaire du dépôt bioconda. C'est-à-dire que tous vos outils, que ce soit samtools, bwa, bowtie, trimmomatic, fastqc et j'en passe, sont disponibles et mis à jour par l’intermédiaire de conda.
    Par ailleurs, conda permet l'utilisation d’environnement virtuel à l'instar de virtualenv (que les utilisateurs de python connaissent bien), vous évitant tous problèmes de dépendances. C'est donc un outil 2 en 1, que nous vous proposons d'explorer dans cet article.

    Je tiens à préciser que je connais pas forcément bien l'environnement Python.