blast ne perment pas de faire une comparaison de génome, mais seulement d'aller a la peche avec une séquence de DNA, RNA ou de proteine pour recherche ds les bases de données de séquences si elle aurait des séquences similaires...
la prédiction de genes peut se faire avec des prediction avec des soft spéciaux (genre genscan par ex), un alignement tres précis sur du hardware spécialisé (genematcher (r)) ou grace a des algos exact (SW/NW), mais en aucun cas avec Blast, qui est une heuristique avec une sensibilité bien trop faible pr faire du travail de précision.
encore une fois, 'recherche des gènes similaires entre espèces et identifier leur différences ... ' ne peux s'envisager qu'avec une validation sur la paillasse, ce qui coute énormément de temps et énormément d'argent.
[^] # Re: Le génome humain libéré
Posté par aurel (site web personnel, Mastodon) . En réponse à la dépêche Le génome humain libéré. Évalué à 4.
la prédiction de genes peut se faire avec des prediction avec des soft spéciaux (genre genscan par ex), un alignement tres précis sur du hardware spécialisé (genematcher (r)) ou grace a des algos exact (SW/NW), mais en aucun cas avec Blast, qui est une heuristique avec une sensibilité bien trop faible pr faire du travail de précision.
encore une fois, 'recherche des gènes similaires entre espèces et identifier leur différences ... ' ne peux s'envisager qu'avec une validation sur la paillasse, ce qui coute énormément de temps et énormément d'argent.