Avec la chemoinformatique, on peut tres vite tomber dans des maths, pas forcement compliques mais interessants par contre. Par exemple, une molecule peut etre vue comme un graphe, donc il y a certains algorithmes de graphe qui sont utiles en chemoinformatique.
Mais bon, je ne suis pas expert dans le domaine, juste un debutant.
Ce que fait ACPC peut d'ailleurs etre vu comme une tache de classification.
Disons que les molecules actives sont de la classe 1 et les molecules inactives de la classe 0.
On score toutes les molecules de la "base de donnees" de molecules en les comparant a une molecule active connue (notre "requete") en esperant que toutes les molecules actives cachees dans la base de donnee auront un score meilleur que toutes les molecules inactives.
Si c'est le cas, alors on a une bonne methode avec une aire sous la courbe proche de 1.0.
Une methode aleatoire aurait une aire sous la courbe proche de 0.5.
Les methodes moins performantes qu'un tri aleatoire des molecules de la base de donnee auront une aire sous la courbe < 0.5.
[^] # Re: Batteries
Posté par zaurus . En réponse au journal Un nouveau logiciel open source pour le criblage "in silico" (chemoinformatique). Évalué à 2.
Avec la chemoinformatique, on peut tres vite tomber dans des maths, pas forcement compliques mais interessants par contre. Par exemple, une molecule peut etre vue comme un graphe, donc il y a certains algorithmes de graphe qui sont utiles en chemoinformatique.
Mais bon, je ne suis pas expert dans le domaine, juste un debutant.
Ce que fait ACPC peut d'ailleurs etre vu comme une tache de classification.
Disons que les molecules actives sont de la classe 1 et les molecules inactives de la classe 0.
On score toutes les molecules de la "base de donnees" de molecules en les comparant a une molecule active connue (notre "requete") en esperant que toutes les molecules actives cachees dans la base de donnee auront un score meilleur que toutes les molecules inactives.
Si c'est le cas, alors on a une bonne methode avec une aire sous la courbe proche de 1.0.
Une methode aleatoire aurait une aire sous la courbe proche de 0.5.
Les methodes moins performantes qu'un tri aleatoire des molecules de la base de donnee auront une aire sous la courbe < 0.5.