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生命科学系データベースアーカイブ

PCDq

タンパク質複合体リスト

データ説明

info データ名 タンパク質複合体リスト
info DOI
info データ内容の説明

タンパク質複合体の情報

info データファイル
データファイル名:
pcdq_complex_list.zip
ファイルサイズ:
136 KB
info 簡易検索URL
info データ取得方法

タンパク質間相互作用データについては 「タンパク質相互作用」に記述したデータを用いました。既知の複合体情報は、文献情報、構造解析結果を人の手によって調べました。

info 解析方法

データベースから取得したタンパク質間相互作用データを統合し、タンパク質とタンパク質間相互作用データセットを作成しました (2007年11月)。 これらから形成されるPPIネットワークから、タンパク質複合体/機能単位の予測を行いました。 そのすべての予測結果について、人手による既知の複合体情報との照合、情報の付加・修正を行いました。

info データ件数

1,266 件

データ詳細

項目名項目の説明
Complex ID 複合体ID
Complex Name 複合体名称
Description 複合体の詳細
CQI CQI (Complex Annotation Quality Check Index)値
品質管理指標
"I.II.III/Total proteins"
(I, II, IIIは「タンパク質複合体メンバー」の項目"Category"の数値 (1,2,3) に対応し、複合体構成タンパク質のうち各カテゴリに属するタンパク質の数を示す。表現CQI=0.0.3/3)
Number of member proteins 複合体のメンバータンパク質数
Complex Type 複合体タイプ
Function Category 機能カテゴリ
Subcellular Localization 細胞内局在

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