BLOCKSリスト

生命科学系データベースアーカイブ

DB-SPIRE

info データ名

BLOCKSリスト

info DOI

info データ内容の説明

BLOCKSのエントリとPDBのエントリおよびチェインへのマッチング状況を示したリストです。

info データファイル

データファイル名:

dbspire_blocks_list.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

113 KB

info 簡易検索URL

info データ取得方法

BLOCKS

info 解析方法

ワード検索、モチーフ検索

info データ件数

5,900 件

項目名	項目の説明
blocksFamilyAC	BLOCKSデータベースのファミリーAC番号
BLOCKS Info	blocksFamilyACに対応するBLOCKS情報のエントリにリンク(簡易検索のみ)
blocksType	このACの由来(PRINTSまたはPROTOMAT)
blocksFamilySize	同じファミリーAC番号を持つBLOCKSエントリの個数
blocksPrints	PRINTSデータベースのAC番号(blocksTypeがPRINTSの場合のみ)
blocksName	BLOCKSデータベースの当該エントリの説明
blocks3dIdFamilySize	MASTによりアノテーション付けされたPDBの個数
blocks3dChainFamilySize	MASTによりアノテーション付けされたPDBチェインの個数
blocks3dSeqIdFamilySize	本データベースでSEQRES配列とマッチングしたPDBの個数
blocks3dSeqChainFamilySize	本データベースでSEQRES配列とマッチングしたPDBチェインの個数
blocks3dAtomIdFamilySize	本データベースでATOM配列とマッチングしたPDBの個数
blocks3dAtomChainFamilySize	本データベースでATOM配列とマッチングしたPDBチェインの個数

このデータベースについて