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生命科学系データベースアーカイブ

DB-SPIRE

PROSITEリスト

データ説明

info データ名 PROSITEリスト
info DOI
info データ内容の説明

PROSITEのエントリとPDBのエントリおよびチェインへのマッチング状況を示したリストです。

info データファイル
データファイル名:
dbspire_prosite_list.zip
ファイルサイズ:
29.1 KB
info 簡易検索URL
info データ取得方法

PROSITE

info 解析方法

ワード検索、モチーフ検索

info データ件数

1,565 件

データ詳細

項目名項目の説明
prositeLisAC PROSITE DO番号
PROSITE Info prositeLisACに対応するPROSITE情報のエントリにリンク(簡易検索のみ)
prositeLisFamilySize PROSITE DO番号に対応するACの個数
prositeLisDE PROSITE DO番号に対応するdescription
prositeLisPatternSize PROSITE DO番号に対応するパターンACの個数
prositeLisRuleSize PROSITE DO番号に対応するルールACの個数
prositeLisRuleWithPASize PROSITE DO番号に対応するパターン・ルールACの個数
prositeLisRuleWithMASize PROSITE DO番号に対応するマトリクス・ルールACの個数
prositeLisMatrixSize PROSITE DO番号に対応するマトリクスACの個数
prosite3dLisIdSize PROSITEのデータベースにアノテーションされているPROSITE DO番号に対応するPDBの個数
prosite3dSeqIdLisSize 本データベースでPROSITE DO番号に対応するSEQRES配列とマッチングしたPDBの個数
prosite3dSeqChainLisSize 本データベースでPROSITE DO番号に対応するSEQRES配列とマッチングしたPDBチェインの個数
prosite3dAtomIdLisSize 本データベースでPROSITE DO番号に対応するATOM配列とマッチングしたPDBの個数
prosite3dAtomChainLisSize 本データベースでPROSITE DO番号に対応するATOM配列とマッチングしたPDBチェインの個数

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