Shoko Ueki

Profile Information

Affiliation

Institute of Plant Science and Resources, Okayama University

Degree

博士(理学)(東京工業大学)

Researcher number

50622023

ORCID iD

https://orcid.org/0000-0002-6558-652X

J-GLOBAL ID

201701010390619576

researchmap Member ID

B000269865

Research Interests

• microbial ecology
• genome biology
• ecophysiology
• Heterosigma akashiwo

Research Areas

• Life sciences / Ecology and environmental science / 生態生理学
• Life sciences / Genomics / 赤潮原因藻
• Life sciences / Molecular biology / ヘテロシグマ

Major Research History

• Sep, 2017 - Present

  Associate Professor, Institute of Plant Science and Resources, Okayama University
• Sep, 2011 - Jul, 2017

  Assistant Professor, Institute of Plant Science and Resources, Okayama University
• Aug, 2007 - Aug, 2011

  Research Assistant Professor, Department of Biochemistry and Cell Biology, State University of New York αt Stony Brook
• Sep, 1998 - Jul, 2007

  Department of Biochemistry and Cell Biology, State University of New York at Stony Brook
• Apr, 1997 - Aug, 1998

  特別研究員, 東京工業大学 生命理工学部, 日本学術振興会

Education

• Apr, 1994 - Mar, 1997

  Graduate School of Bioscience and Biotechnology, Tokyo Institute of Technology
• Apr, 1992 - Jul, 1994

  Master's Program in Environmental Sciences, University of Tsukuba
• Apr, 1988 - Mar, 1992

  School of Science, Nagoya University

Awards

• Mar, 2013

  長瀬研究振興賞, 公益財団法人長瀬科学技術振興財団

  植木尚子

Major Papers

• Proliferation of a bloom-forming phytoplankton via uptake of polyphosphate-accumulating bacteria under phosphate-limiting conditions

  Seiya Fukuyama, Fumiko Usami, Ryuichi Hirota, Ayano Satoh, Shizuka Ohara, Ken Kondo, Yuki Gomibuchi, Takuo Yasunaga, Toshimitsu Onduka, Akio Kuroda …

  ISME Communications, 5(1), Jan 17, 2025 Last authorCorresponding author

Books and Other Publications

• 赤潮大全 漁業被害の防止・軽減に向けて

  植木尚子

  緑書房, Mar, 2026 (ISBN: 9784868110538)
• Natural resistance mechanisms of plants to viruses

  Loebenstein, G. (Gad), Carr, John Peter

  Springer, 2006 (ISBN: 1402037791)

Presentations

• Study on bacterivory and nutrition acquisition of Heterosigma akashiwo

  Shoko Ueki

  Dec 4, 2024
• リン欠乏状態における海洋細菌による赤潮原因藻の増殖促進機構の解明

  福山 誠也, 宇佐美 文子, 小原 静香, 隠塚 俊光, 近藤 健, 小池 和彦, 植木 尚子

  おかやまバイオアクティブ研究会, Jun 6, 2024
• A marine bacterium promotes the growth of a bloom-forming phytoplankton under phosphorus-depletion

  Seiya Fukuyama, Fumiko Usami, Shizuka Ohara, Toshimitsu Onduka, Ken Kondo, Kazuhiko Koike, Shoko Ueki

  Nov 28, 2023
• Characterization of marine bacteria that support growth of Heterosigma akashiwo under phosphate-limiting conditions

  Shoko Ueki

  International Conference on Harmful Algae 2023, Nov 6, 2023
• Characterization of Marine Bacteria That Support Growth of Harmful Algae Under Nutritionally Limiting Conditions.

  Shoko Ueki

  Annual Meeting of Society of Microbiology in Chile, Nov 30, 2021 Invited
• リン欠乏条件下においてHeterosigma akashiwoがリン源とするポリリン酸合成細菌の発見.

  宇佐美文子, 小原静香, 隠塚俊満, 近藤健, 中嶋昌紀, 小池一彦, 植木尚子

  微生物生態学会年会, Oct 30, 2021
• Gene Manipulation Techniques in Heterosigma Akashiwo

  Nanami Nakayama , Shoko Ueki , Ayano Satoh

  日本分子生物学会年会, 日本分子生物学会
• 赤潮原因種Heterosigma akashiwoの遺伝子操作技術

  中山七海,植木尚子,佐藤あやの

  日本生物工学会西日本支部大会(第5回講演会), 日本生物工学会
• 赤潮原因藻ヘテロシグマの系統地理学的マーカーの確立を目指した研究

  妹尾美紀, 平松諒也, Anette Engesmo, Brian D. Bill, Vera L. Trainer, 長井敏, 門田有希, 植木尚子

  日本育種学会・第 11 回中国地域育種談話会, 岡山大学
• 赤潮原因藻ヘテロシグマのバイオテクノロジー的利用をめざした遺伝子導入法の検討

  佐藤あやの、楠本恭平、植木尚子

  赤潮原因藻ヘテロシグマのバイオテクノロジー的利用をめざした遺伝子導入法の検討, 日本分子生物学会
• Toward understanding ecophysiology of a bloom-forming alga, Heterosigma akashiwo

  Shoko Ueki

  International Symposium: "Advances in Environmental Microbiology and Microbial Biotechnology", N?cleo Cient?fico Tecnol?gico de la Universidad de La Frontera BIOREN-UFRO Invited
• A hypervariable mitochondrial gene associated with geographical origin in a cosmopolitan bloom-forming alga, Heterosigma akashiwo

  Shoko Ueki

  International Conference for Harmful Algae, International Society for the Study of Harmful Algae
• 赤潮原因藻ヘテロシグマのミトコンドリア・ゲノム上に存在する水域特異的な超可変領域配列についての研究

  植木 尚子

  2017環境微生物学系学会合同年会, 東北大学
• Whole Genome sequence of Heterosigma akashiwo virus 53

  Shoko Ueki

  8th Aquatic Virus workshop, Plymouth University
• 大型二本鎖DNAウイルス:多因子・多層制御による宿主感染機序の理解を目指して

  植木尚子

  新学術領域研究『ゲノム支援』拡大班会議, 新学術領域研究『ゲノム支援』遺伝研事務局
• 大型二本鎖DNAウイルス:多因子・多層制御による宿主感染機序の理解を目指して

  植木尚子

  ウイルス感染現象における宿主細胞コンピテンシーの分子基盤 第6回領域会議, ウイルス感染現象における宿主細胞コンピテンシーの分子基盤 領域事務局
• Growth promotion of Heterosigma akashiwo by marine microorganisms; implication of marine bacterium in bloom formation

  Shoko Ueki

  16th International Conference of Harmful Algae
• ウイルス・宿主共存機構:宿主個体群構造ダイナミクスの生理生態学的・数理学的解析

  植木 尚子

  新学術領域研究『ゲノム支援』拡大班会議

Teaching Experience

• Apr, 2022 - Present

  Topics in Plant Microbe Interactions (Okayama University)
• Oct, 2021 - Present

  Plant physiology 1 (Okayama University)
• Apr, 2020 - Present

  Specific Research of Bioresources Science (Okayama University)
• Apr, 2018 - Present

  Plant-Virus/Bacteria Interactions (Okayama University)
• Sep, 2005 - Aug, 2007

  Basics of Bioinformatics for Undergraduates BIO301 (Stony Brook University)

Professional Memberships

• 2016 - Present

  日本微生物生態学会

Major Research Projects

• ラフィド藻ヘテロシグマをモデルとした赤潮形成を支える増殖加速と代謝機構の解明

  科学研究費助成事業, 基盤研究(B), 日本学術振興会, Apr, 2025 - Mar, 2029

  植木 尚子, 坂本 美佳, 中根 大介
• 赤潮原因藻ヘテロシグマの増殖加速の原因となる遺伝子変異およびエピゲノム制御の探索

  科学研究費助成事業, 挑戦的研究(萌芽), 日本学術振興会, Jun, 2026 - Mar, 2028
• 赤潮原因藻ヘテロシグマの赤潮形成期における増殖加速機構の解明を目指した研究

  科学研究費助成事業, 挑戦的研究(萌芽), 日本学術振興会, Jun, 2024 - Mar, 2026

  植木 尚子, 坂本 美佳, 佐藤 あやの
• Toward the understanding of the contribution of marine bacterial metabolism on nutritional requirement for algal bloom formation

  Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2021 - Mar, 2025

  Ueki Shoko
• Characterization of a novel bloom-forming mechanism based on interaction between astaxanthin-producing marine bacteria and a bloom-forming alga

  Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory), Japan Society for the Promotion of Science, Jul, 2021 - Mar, 2024

  Ueki Shoko
• チリにおける持続可能な沿岸漁業及び養殖に資する赤潮早期予測システムの構築と運用

  地球規模課題対応国際科学技術協力プログラム, 生物資源, 日本科学技術振興機構, Apr, 2018 - Mar, 2023
• 赤潮形成を促進する海洋細菌の単離同定と、赤潮動態予測法の開発

  大阪湾圏域の海域環境再生・創造に関する研究助成制度, 特定非営利活動法人 瀬戸内海研究会議, Apr, 2019 - Mar, 2022

  植木尚子
• 赤潮発生の謎を解く 〜赤潮原因藻の増殖速度制御機構の解明〜

  積水化学 自然に学ぶものづくり助成, 積水化学工業株式会社, Oct, 2018 - Sep, 2019
• 大型二本鎖DNAウイルス:多因子・多層制御による宿主感染機序の理解を目指して

  科学研究費助成事業, 新学術領域研究(研究領域提案型), 日本学術振興会, Apr, 2015 - Mar, 2017

  植木 尚子
• Study of population dynamics of host population during viral infection

  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2014 - Mar, 2017

  Ueki Shoko, Higashi Aiko, Kobashi Rieko
• Regulation mechanism of propagation of Heterosigma akashiwo in environment

  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2014 - Mar, 2016

  Ueki Shoko, Nakayama Natsuko
• 赤潮発生メカニズムの環境微生物学的理解を目指した研究

  環境研究助成, 住友財団, Nov, 2013 - Oct, 2014
• 赤潮原因害藻ヘテロシグマの産業利用を可能にする基盤技術の確立

  カシオ科学振興研究助成金, Dec, 2012 - Nov, 2013
• 赤潮プランクトンの驚異的な増殖能力を有用物質生産に利用するための基礎的研究

  長瀬科学技術振興財団研究助成金, 長瀬科学技術振興財団, Apr, 2012 - Mar, 2013
• トランスグルタミナーゼによる細胞接着反応に関する基礎的研究

  科学研究費助成事業 特別研究員奨励費, 特別研究員奨励費, 日本学術振興会, 1998 - 1999

  植木 尚子

Social Activities

• Ohara Summer Science Internship

  Planner, Logistic support

  Institute of Plant Science and Resources, Okayama University, Aug 29, 2023 - Sep 1, 2023
• 大原サマーサイエンスインターンシップ

  Planner, Logistic support

  岡山大学 資源植物科学研究所, 大原サマーサイエンスインターンシップ, Sep 5, 2022 - Sep 8, 2022

Media Coverage

• Dra Shoko Ueki, de la Univ. de Okayama y del Proyecto MACH, imparte charla sobre las algas nocivas.

  Colegio San Mateo de la Compañía de Jesús, Dra Shoko Ueki, de la Univ. de Okayama y del Proyecto MACH, imparte charla sobre las algas nocivas., Mar, 2023 TV or radio program

Other

• Heterosigma akashiwo transcriptome assembly and annotation

  Mar, 2023

  Transcriptome shotgun assembly (TSA) can be obateinded from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/wgs/ICRV01 Annotation for the TSAa can be obtained from 10.5061/dryad.m0cfxpp56
• ラボHP

  https://www.rib.okayama-u.ac.jp/inv/index-j.html