Un standard ouvert d'archivage de l'information sur ADN.
CI Spec version License Status Site Discussions
L'ADN permet de stocker ~215 pétaoctets par gramme, sans énergie, pendant des millénaires. C'est le meilleur support d'archive à long terme jamais découvert. Mais aujourd'hui, chaque acteur industriel (Microsoft, Twist, Catalog...) invente son propre format, propriétaire et incompatible.
AeonScript est le standard ouvert qui manque. Pensez TCP/IP pour le stockage ADN.
→ Lire le Manifeste.
AeonScript est :
- 🧬 Une spécification ouverte d'encodage de données numériques sur ADN
- 📐 Une architecture en 7 couches (OSI-like : physique, multiplexage, transport, addressage, session, présentation, application)
- 🤖 Une encodeur AI-natif exploitant les modèles de fondation génomiques (Evo 2 et successeurs)
- 🏷️ Un format auto-descriptif avec tags sémantiques hiérarchiques
- 🛡️ Un protocole bio-safe avec filtrage des séquences pathogènes obligatoire
- 📂 Une implémentation de référence en Python (Rust prévu)
git clone https://github.com/aeonscript-spec/aeonscript.git cd aeonscript/reference pip install -e .
from aeonscript import encode_file, decode_oligos # Encoder un texte en oligos ADN oligos = encode_file("mon_document.txt") print(f"Encodé en {len(oligos)} oligos de ~200 bases chacun") # → Liste de séquences ACGT prêtes à être synthétisées # Décoder content = decode_oligos(oligos) with open("mon_document_decoded.txt", "wb") as f: f.write(content)
python reference/examples/encode_demo.py
→ Cet exemple encode un court extrait textuel, ajoute des erreurs aléatoires (simulant les erreurs de séquençage), puis vérifie que le décodage correct fonctionne.
aeonscript/
├── MANIFESTO.md # Pourquoi ce projet existe
├── README.md # Ce fichier
├── LICENSE # MIT (code) + CC-BY-SA (docs)
├── ROADMAP.md # Feuille de route
├── CONTRIBUTING.md # Comment contribuer
├── spec/
│ ├── SPEC-v0.1.md # Spécification technique principale
│ └── layers/ # Détails par couche
├── reference/
│ ├── aeonscript/ # Module Python
│ │ ├── physical.py # L1 — Encodage binaire → ACGT
│ │ ├── error_correction.py # L4 — Reed-Solomon
│ │ ├── semantic.py # L5 — Tags sémantiques
│ │ ├── encoder.py # API haut niveau
│ │ └── decoder.py
│ ├── tests/ # Tests round-trip
│ └── examples/ # Démos exécutables
└── docs/
└── architecture.md # Schémas et explications
| Niveau | Couche | Rôle |
|---|---|---|
| L7 | Application | Formats de domaine (PDF-ADN, FASTA-ADN...) |
| L6 | Presentation | Sérialisation, compression, chiffrement |
| L5 | Session | Tags sémantiques, addressage hiérarchique |
| L4 | Transport | Reed-Solomon + LDPC (correction d'erreurs) |
| L3 | Network | Random access par amorces PCR + indexation |
| L2 | Data Link | Multiplexage brins fwd/rev, cadres de lecture |
| L1 | Physical | Alphabet 4-6 lettres, méthylation, contraintes biochimiques |
Détails complets dans spec/SPEC-v0.1.md.
✅ Manifeste publié ✅ Spec v0.1 rédigée (couches L1, L4, L5 finalisées) ✅ Implémentation Python de référence (L1 + L4 + L5) ✅ Tests round-trip fonctionnels 🔲 Spec couches L2 (multiplexage brin/frame) — en cours 🔲 Spec couche L3 (random access PCR) — en cours 🔲 Port Rust (performance) 🔲 Intégration foundation model (Evo 2) pour codec AI-natif 🔲 Démonstration physique (synthèse + relecture)
AeonScript est ouvert à toute contribution. Voir CONTRIBUTING.md.
Domaines où l'aide est particulièrement précieuse :
- Bio-informatique : validation des contraintes biochimiques
- Théorie de l'information : optimisation des codes correcteurs cross-layer
- Foundation models : intégration de Evo 2 / Caduceus comme codec
- Rust : port de performance du codec Python
- Documentation : traductions, tutoriels, exemples
- Standardisation : aide pour soumission ISO/W3C
- Sécurité : audit des protocoles bio-safety
AeonScript est le socle d'une famille de projets ouverts :
| Projet | Rôle | Lien |
|---|---|---|
| AeonScript | Le standard de stockage d'information sur ADN | aeonscript.org |
| AeonProof | Coffre-fort de preuves d'authenticité à l'ère des fakes — la crypto détecte, l'ADN archive | proof.aeonscript.org · repo |
AeonProof est bâti sur AeonScript : il grave les preuves d'authenticité (hash + signature + horodatage) dans l'ADN via le format AeonScript.
- Code (
reference/) : MIT License - Documentation (
MANIFESTO.md,spec/,docs/) : Creative Commons CC-BY-SA 4.0
Voir LICENSE.
Si vous utilisez AeonScript dans une publication académique :
@misc{aeonscript2026, title = {AeonScript: An Open Standard for DNA-Based Information Archival}, author = {{The AeonScript Contributors}}, year = {2026}, url = {https://github.com/aeonscript-spec/aeonscript}, note = {Version 0.1} }
- Discussions : GitHub Issues
- Sécurité : security@aeonscript.org (TBD)
- Presse / institutionnel : contact@aeonscript.org (TBD)
« La mémoire de l'humanité ne devrait pas être propriétaire. »