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整理我的浏览器收藏夹,太多年了〜!放在这里的目的是为了方便整理和查找,针对团队成员的一些学习和培养,有专门整理的一些初步资料方便最基础入门。
本次更新根据最新的 Edge 浏览器收藏夹进行了全面、系统、深度的梳理与去噪,过滤了所有个人账户、内网系统、行政管理、敏感隐私以及与学术开发无关的链接,并按照七大专业分类将其模块化管理,以提高日常科研与软件开发的检索效率。
下图展示了当前仓库经系统化重构后的分类框架:
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Root[Curated-List 主索引] --> Cat1[📚 学术研究与科研工具]
Root --> Cat2[🧬 生信分析与计算工具]
Root --> Cat3[🗄️ 生物医学数据库]
Root --> Cat4[💻 软件开发与系统配置]
Root --> Cat5[📊 数据科学与绘图可视化]
Root --> Cat6[🧠 人工智能与机器学习]
Root --> Cat7[🎓 学习教程与博客社区]
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| 模块列表 | 描述摘要 | 核心收录主题 |
|---|---|---|
| 📚 学术研究与科研工具 | 科研日常学术服务与论文工具 | 学术期刊、科研绘图、论文润色与投稿、学术团队、实验协议、文献检索 |
| 🧬 生信分析与计算工具 | 基因组与多组学计算分析软件 | NGS、单细胞测序、HLA分型、变异检测与注释、生存分析、数字病理、生信流程 |
| 🗄️ 生物医学数据库与在线平台 | 全球大型生命医学和多组学数据库 | 综合数据中心、TCGA、ICGC、单细胞转录组、免疫组学、药物反应、注释数据库 |
| 💻 软件开发与系统运维 | 跨平台语言开发、工具配置与部署 | R/Python/Go/Rust/Julia开发、VS Code配置、系统调优、Docker容器化、通用库 |
| 📊 数据科学与绘图可视化 | 数据预处理、统计建模与绘图设计 | 数据清洗、统计分析、机器学习建模、数据可视化、排版字体、配色方案 |
| 🧠 人工智能与机器学习 | 深度学习与大语言模型前沿工具 | 传统机器学习、神经网络架构、LLM本地推理引擎、在线AI平台、AI搜索 |
| 🎓 学习教程与博客社区 | 开发者学习资料、技术问答与社区 | 编程书籍(R/Python/Go)、在线课程、官方文档、开发者社区、经典技术博文 |
本节保留并优化了原清单中最核心、最适合团队入门与打底的黄金资源,方便新成员快速检索和上手:
- Artificial Intelligence for Beginners - 微软开源的人工智能初学者课程
- roadmap.sh - 全球开发者学习路线图与核心知识库
- Made With ML - 结合机器学习与生产工程实践的系统课程
- DevDocs - 极速离线开发者 API 文档汇总
- PyTorch Tutorials - 官方 PyTorch 基础与进阶实战教程
- 深度学习经典论文逐段精读 - 李沐老师的论文精读与科学研究方法引导
- Computational Systems Biology: Deep Learning in the Life Sciences - MIT 生物系统计算与生命科学中的深度学习课程
- Git教程 - 廖雪峰 - 国内公认最通俗易懂的 Git 快速入门教程
- Makefile教程 - 廖雪峰 - 面向 C++/C 编译及自动化构建的实用小册
- Python教程 - 廖雪峰 - Python 3 基础语法与核心功能精讲
- R for Data Science (2e) - Hadley Wickham 主笔的数据科学经典,现代 R 语言必备
- ggplot2: Elegant Graphics for Data Analysis - 统计绘图神器 ggplot2 的官方权威指南
- Modern Statistics for Modern Biology - 现代生物信息学与多组学统计方法的经典教材
- Modern Statistics with R - 利用 R 语言进行假设检验、回归和机器学习的实战用书
- Biomedical Data Science (PH525x) - 哈佛大学生物医学数据分析系列经典
- BED Format - 基因组区域与区间范围数据格式标准
- MAF Format (Mutation Annotation Format) - 癌症体细胞突变信息注释数据格式标准
- VEP Format (Variant Effect Predictor) - Ensembl 基因突变效应预测及其数据结构规范
- 清华大学开源软件镜像站 - 提供 Anaconda、Bioconda、R/CRAN 等学术包的极速同步
- 中国科学技术大学开源软件镜像 - 国内一流的 Linux 发行版与语言工具源镜像
- 南京大学开源镜像站 - 提供全面、高速的基础编译软件与平台镜像支持
- FTP 开源资源:NCBI FTP Server | Ensembl FTP Server | GNU FTP Server
如果您有优秀的生信工具、数据库或开发资源推荐,欢迎提交 Pull Request!为保证本清单的学术性、纯净性与公共服务性,提交时请遵循以下规则:
- 严格学术相关:不收录个人账户页面、任何带有 session 信息或需内部认证的私有链接。
- 剔除冗余与低质:不收录临时查询页面、重复的搜索引擎主页、已失效的死链。
- 清晰分类:根据资源的主要功能,放置于对应的子 Markdown 文件中,并保持名称简洁。