| 項目名 | 項目の説明 |
|---|
| Primer |
HiCEPプライマーセットの種類(5'末端-3'末端) |
| Peak No |
シーケンサーで同定されたDNA断片のピーク番号 |
| 2(0) Height min |
サンプル:播種後2日、浸水0日
シーケンシングによって得られたピークのうち最小値 |
| 2(0) Height max |
サンプル:播種後2日、浸水0日
シーケンシングによって得られたピークのうち最大値 |
| 2.5(0) Height min |
サンプル:播種後2.5日、浸水0日(対照群)
シーケンシングによって得られたピークのうち最小値 |
| 2.5(0) Height max |
サンプル:播種後2.5日、浸水0日(対照群)
シーケンシングによって得られたピークのうち最大値 |
| 2.5(0.5) Height min |
サンプル:播種後2.5日、浸水0.5日
シーケンシングによって得られたピークのうち最小値 |
| 2.5(0.5) Height max |
サンプル:播種後2.5日、浸水0.5日
シーケンシングによって得られたピークのうち最大値 |
| 3(0) Height min |
サンプル:播種後3日、浸水0日(対照群)
シーケンシングによって得られたピークのうち最小値 |
| 3(0) Height max |
サンプル:播種後3日、浸水0日(対照群)
シーケンシングによって得られたピークのうち最大値 |
| 3(1) Height min |
サンプル:播種後3日、浸水1日
シーケンシングによって得られたピークのうち最小値 |
| 3(1) Height max |
サンプル:播種後3日、浸水1日
シーケンシングによって得られたピークのうち最大値 |
| 3.5(0) Height min |
サンプル:播種後3.5日、浸水0日(対照群)
シーケンシングによって得られたピークのうち最小値 |
| 3.5(0) Height max |
サンプル:播種後3.5日、浸水0日(対照群)
シーケンシングによって得られたピークのうち最大値 |
| 3.5(1.5) Height min |
サンプル:播種後3.5日、浸水1.5日
シーケンシングによって得られたピークのうち最小値 |
| 3.5(1.5) Height max |
サンプル:播種後3.5日、浸水1.5日
シーケンシングによって得られたピークのうち最大値 |
| 4(0) Height min |
サンプル:播種後4日、浸水0日(対照群)
シーケンシングによって得られたピークのうち最小値 |
| 4(0) Height max |
サンプル:播種後4日、浸水0日(対照群)
シーケンシングによって得られたピークのうち最大値 |
| 4(2) Height min |
サンプル:播種後4日、浸水2日
シーケンシングによって得られたピークのうち最小値 |
| 4(2) Height max |
サンプル:播種後4日、浸水2日
シーケンシングによって得られたピークのうち最大値 |
| Size min |
シーケンシングによって得られたDNA断片の分子量のうち最小値 |
| Size max |
シーケンシングによって得られたDNA断片の分子量のうち最大値 |
| 1_Cluster_No |
1回目のクラスタリングの結果分類したクラスタ番号(0-31) |
| 2_Cluster_No |
1回目のクラスタリングの結果、以下の条件を満たしたものに対して2回目のクラスタリングを行った結果分類したクラスタ番号(1-65)
条件:
・1回目のクラスタリングにおいてクラスタ31に分類されている
・ピークの最大値/最小値 > 3となっている |
| 3_Peak_No |
「ダイズオミックスデータ」に収録されたグラフ番号で、対象になるのは以下の条件を満たしたものである
条件:
浸水したサンプルのピーク値 / 対照群のピーク値 > 20 |