データ説明 |
| info データ名 | イネESTマッピング結果の詳細情報 |
| info DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00318-04-002 |
| info データ内容の説明 | 特異的クローンのESTプライマーを使用したPCRベースのYACスクリーニングの詳細結果。 |
| info データファイル |
データファイル名: rgp_estmap2001_detail.zip
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| info 簡易検索URL | http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rgp_estmap2001_detail |
| info データ取得方法 | 19のcDNAライブラリーに由来する6713個のユニークなEST配列(3'末端)から設計された特異的クローンのプライマー対を使用。 |
| info 解析方法 | YACスクリーニングデータの分析およびESTマップ構築のためにSEGMAP(バージョン3.48)を使用しました。
遺伝子マーカーまたはESTクローンを有するYACまたはイネのゲノムDNAのDNAゲルブロットハイブリダイゼーションは、ECLシステム(Amersham、バッキンガムシャー、UK)を用いて実施しました。
注釈
#; 遺伝子地図上のフローティングマーカー
c; キメラYACクローン
*; 予測より長いPCRバンドサイズ
Ann T; 特に明記しない限り 60°C
NI; 未知の挿入物を有するYAC |
| info データ件数 | 6,760 件 |
データ詳細 |
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|
| Anchor |
YACのランディングに使用される遺伝子マーカー |
| Chrom. No. |
染色体番号 |
| Position (cM) |
前のマーカーとの遺伝的距離 (cM) |
| EST Clone |
ESTクローン (部位) 名 |
| DDBJ Acc FW |
ESTクローン (正方向配列) のDDBJアクセション番号 |
| DDBJ Acc RV |
ESTクローン (逆方向配列) のDDBJアクセション番号 |
| Positive YACs |
ポジティブYAC名 |
| PCR Primer |
PCRプライマー名 |
| Amplified Band Size |
増幅PCRバンドサイズ (kb) |
| Ann T |
アニーリング温度 (°C) |
| 5'-Primer Sequence |
プライマー配列 (5'プライマー、20塩基) |
| 3'-Primer Sequence |
プライマー配列 (3'プライマー、20塩基) |
| Map Image File |
イネ転写産物地図の画像ファイル名 |
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