ショウジョウバエGal4エンハンサートラップ系統のゲノム挿入位置のクラスタリングデータテーブル(Cluster List)

生命科学系データベースアーカイブ

GETDB

info データ名

ショウジョウバエGal4エンハンサートラップ系統のゲノム挿入位置のクラスタリングデータテーブル(Cluster List)

info DOI

info データ内容の説明

ショウジョウバエGal4エンハンサートラップエレメントの挿入位置を、相互の位置の近さによってクラスタリングしたクラスタデータ。2,099クラスタ。

info データファイル

データファイル名:

getdb_cluster.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

56KB

info 簡易検索URL

info データ取得方法

info 解析方法

Blastによるマッピング(Berkeley Drosophila Genome Project(BDGP)/Celeraによって決定されたゲノム配列 (Release 3.1)をターゲット配列としてマッピング)

info データ件数

2,099件

項目名	主キー	外部キー	項目の説明
ClusterId	ゲノム挿入座標のクラスタID
Cluster Member(Clone Name : Cluster Id)	クラスタに属する挿入点列のそれぞれに対応するClone Name
Cluster Size	クラスタに属する挿入座標の数
Link to Clone Table	Cluster ID。(TogoDBではCloneTableへのリンク)
Link to Strain Table	Cluster ID。(TogoDBではStrain Tableへのリンク)
Chr. Band	染色体バンド
Insertion Point (Min)	ゲノム配列上の挿入位置のクラスター内での最小値
Insertion Point (Max)	ゲノム配列上の挿入位置のクラスター内での最大値
Max-Min	ゲノム配列上の挿入位置の最大値-最小値

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