CAGEscan法による実験結果のサマリを核酸配列ライブラリ毎にまとめたもの。
CAGEscan法(http://fantom.gsc.riken.jp/jp/protocols/nanocage.html)
61 件
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| Library ID | 核酸配列ライブラリのID |
| Raw | 計測されたリード数 |
| Removed by extraction | 抽出により削除したリード数 |
| Extracted | 解析により抽出したリード数 |
| Removed by artifacts | 削除した人工リード(artifact)数 |
| Filtered for artifact | artifactを削除した後のリード数 |
| Removed by rRNA | rRNAとして削除したリード数 |
| Filtered for rRNA | rRNAを削除した後のリード数 |
| Non alignment | ゲノムにマッピングできなかったリード数 |
| Genome mapped | ゲノムにマッピングされたリード数 |
| Duplicated | 重複のあるリード数 |
| Uniquely mapped | 重複のないリード数 |
| Inproperly mapped pairs | ゲノムに適切にマッピングされなかったリードのペア数 |
| Properly mapped pairs | ゲノムに適切にマッピングされたリードのペア数 |
| Total pairs | ペアの総数 |
| Exon | エクソンにあるペア数 |
| Intergenic | エクソンの間にあるペア数 |
| Promoter | プロモーターにあるペア数 |