データ説明 | |||||||||||||||||||
| info データ名 | Genotype Data (Phase III) | ||||||||||||||||||
| info DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00036-006 | ||||||||||||||||||
| info データ内容の説明 | D3(Phase III)の遺伝子型データ(876K SNP、87サンプル分)。 | ||||||||||||||||||
| info データファイル | データファイル名: mole_info_DhaploD3.txt.gz ファイルサイズ: 23.8MB | ||||||||||||||||||
| info 簡易検索URL | - | ||||||||||||||||||
| info データ取得方法 | Affymetrix SNP 6.0 arrays によるジェノタイピング | ||||||||||||||||||
| info 解析方法 | 全胞状奇胎(CHM)100検体をAffymetrix SNP 6.0 arrays でジェノタイピングした。アノテーションにはゲノム参照配列 NCBI Build36 を使用した。Kukita et al.(2010)に記載の方法に従って、蛍光シグナル比(log2R)が低値であったSNP、CNV解析により欠失領域にあると判定されたSNP、およびヘテロと判定されたSNPをノーコールに変換した。このあとサンプルコール率およびSNPコール率によるQCを行い最終的に87CHMについての876KSNPのタイピング結果を取得した。 | ||||||||||||||||||
| info データ件数 | 876,399件 | ||||||||||||||||||
データ詳細 | |||||||||||||||||||
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