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生命科学系データベースアーカイブ

ClEST

クラスター

データ説明

info データ名 クラスター
info DOI
info データ内容の説明

Blastx相同性検索やGOアノテーションを含むクラスター情報

info データファイル
データファイル名:
clest_cluster.zip
ファイルサイズ:
525 KB
info 簡易検索URL
info データ取得方法

「Clone」データ

info 解析方法

Phred/phrapによるクラスタリング、NCBIのNon-redundantタンパク質データベースに対するBlastx相同性検索、Blast2GOを用いたGOアノテーションとDescriptionの記載

info データ件数

3,161 件

データ詳細

項目名項目の説明
Cluster ID クラスターID
Description 予測された遺伝子機能
Category 配列の分類
Length コンセンサス配列長
Sequence コンセンサス配列
Source 由来クローン
No. of clones 由来クローンの数
Top Blastx hit (E value < 1e-6) Blastx検索トップヒットの遺伝子名
ACC No. Blastx検索トップヒットのアクセッションナンバー
E-value Blastx検索トップヒットのE-value
GO GOアノテーション

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