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生命科学系データベースアーカイブ

AcEST

BlastX Result : TrEMBL

データ説明

info データ名 BlastX Result : TrEMBL
info DOI
info データ内容の説明

ホウライシダ EST(AcEST, Adiantum capillus-veneris EST)配列と、UniProtKB/TrEMBL(release 39.9) データベースとの間でblastx検索を実行した結果。Blastxヒットリストのうち、各ヒットのアラインメント情報を一つの行に記載。 CSV 形式テキストファイル。

info データファイル
データファイル名:
blasthits_tr.zip
ファイルサイズ:
7.03MB
info 簡易検索URL
info データ取得方法

blastx検索

info 解析方法

ホウライシダEST配列と、UniProtKB/TrEMBL データベースとの間でblastx検索を実行した。

info データ件数

303,873ヒット

データ詳細

項目名項目の説明
Query blastX検索を行ったホウライシダEST配列のクローンID
BlastX Hits UniProtKB/TrEMBL (release 39.9) データベースとの間でblastx検索を行い、ヒットした配列のAccessionとDefinition。 TogoDBでは、Uniprotへのリンク。
Align Length 上記ヒットした配列と、ホウライシダEST配列との間のアライメント長
Bit score 上記ヒットした配列と、ホウライシダEST配列との間のアライメントのScore (bit)
E-value 上記ヒットした配列と、ホウライシダEST配列との間のアライメントのE-value
Report UniProtKB/TrEMBL(release 39.9)データベースとのblastx検索結果
UniProt ID 上記ヒットした配列のUniProt ID

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