データベース全般
info 名称の読み方 ティーエムピーディービー
info 別名 TransMembrane Protein DataBase
info 連絡先 〒036-8561 弘前市文京町3番地
弘前大学大学院 理工学研究科 電子情報工学科
E-Mail:
info データベース分類 タンパク質配列データベース-タンパク質の局在とターゲッティング
info データベースの説明 収集した膜貫通トポロジーに関する文献 (1074論文) から、X線結晶構造回折、NMR、遺伝子融合などの実験によって決定された、信頼度の高い302の膜貫通トポロジーモデルを抽出し、それらをSWISS- PROTなどのデータベースと結びつけることによって、膜貫通トポロジーデータベース (TMPDB) として構築した。
info データベースの特長・有用性・活用方法 TMPDBは膜貫通トポロジー予測法開発や、既存の予測法の改良のためのトレーニングあるいはテストデータセットとして有用である。
info データベースの利用許諾 CC 表示-継承
詳細
info 予算的背景・プロジェクト
名称:
文部科学省特定領域研究 ゲノム研究
J-GLOBALへのリンク
info 論文等
文献名:
TMPDB: a database of experimentally-characterized transmembrane topologies.
著者名:
Ikeda, M., Arai, M., Okuno, T. and Shimizu, T.
雑誌名/掲載年月/号:
Nucleic Acids Res., 31, 406-409.
外部リンク:
PubMedへのリンク
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データベースのオリジナルサイト情報
info オリジナルサイト -
info 運用開始年月日 -
info 最終更新年月日 2003/11
info 統括サイト -
info データの一括ダウンロードサイト -
info 一覧表示 無し
info クエリ検索 無し
info Webサービス 無し
info WebサービスURL -
info ユーザ登録 無し