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生命科学系データベースアーカイブ

RGP gmap98

連鎖順序情報

データ説明

info データ名 連鎖順序情報
info DOI
info データ内容の説明

連鎖地図を作製した時のフレームとなる1174個のマーカーについて染色体ごとに、マーカー名、次のマーカーとの距離、遺伝型が決定できた個体数及びマーカーの遺伝形式のリストです。

info データファイル
データファイル名:
rgp_gmap98_linkage_order.zip
ファイルサイズ:
8.7 KB
info 簡易検索URL
info データ取得方法 -
info 解析方法

windowサイズ「5」、LOD閾値「2.0」で「ripple」コマンドを実行し、染色体全体での異なる位置にあるマーカーの最適な並び順を調べました。

info データ件数

1,174 件

データ詳細

項目名項目の説明
Chrom. No. 染色体番号
Order 連鎖順序
Markers マーカー名
Distance 順序が1つ後ろのマーカーまでの遺伝的距離(cM)
Genotypes mapping populationにおけるマーカーごとに観測された遺伝子型の数
codom:共優性マーカー
+/-:優性マーカー

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