データ説明 |
| info データ名 | イネESTマッピング結果の統計情報 |
| info DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00318-04-001 |
| info データ内容の説明 | 各染色体ごとのイネESTマッピング結果の概要。
地図は、6421のユニークな配列から設計された6591個のEST部位を有する364個のYACコンティグを含む、2782個のYACクローンで構成され、イネのゲノムの80.8%をカバーしています。 |
| info データファイル |
データファイル名: rgp_estmap2001_main.zip
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| info 簡易検索URL | http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rgp_estmap2001_main |
| info データ取得方法 | YACベースのイネ転写産物地図作成に関連する数値データ |
| info 解析方法 | 各染色体ごとのイネESTマッピングを作るために使用したYACクローン、YACコンティグの数を種類ごとにまとめました。また、カバレッジ、平均EST密度を算出しました。 |
| info データ件数 | 14 件 |
データ詳細 |
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|
| Chrom. No. |
染色体番号
(UN: Chromosome unknown) |
| YAC Clones |
YACクローンの数 |
| YAC Contigs |
YACコンティグの数 |
| Total Length of YAC Contigs (Mb) |
YACコンティグの全長 (Mb) |
| Coverage (%) |
カバー率
「YACコンティグの全長(Mb)/(染色体の遺伝子長(cM) X 430(Mb)/1,530.4(cM)) X 100」で算出。 |
| EST Sites |
EST部位の数 |
| Ave EST Density (EST/100 kb) |
平均EST密度 (EST/100 kb)。
「EST数/YACコンティグの全長」で算出。 |
| Contig Image File |
染色体分布図の画像ファイル名 |
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