データベース全般
info 名称の読み方 -
info 別名 RGP: 332 PCR-based genetic markers on rice chromosomes
info 連絡先 〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2
国立研究開発法人 農業生物資源研究所
松本隆
E-mail : rgp_caps_address
片寄裕一
E-mail : rgp_caps_address2
info データベース分類 植物データベース-イネ
info データベース分類 配列
PCRマーカー
info データベースの説明 我々は161個のsequence tagged site(STS)マーカーと171個のcleaved amplified polymorphic sequence (CAPS)マーカーを含む、332個のPCR法による遺伝マーカーを開発しました。このページではこれらマーカー情報を提供します。
info データベースの特長・有用性・活用方法 STSマーカーやCAPSマーカーについての染色体上の位置、プライマー配列、増幅断片(日本晴)の大きさ、制限酵素といったあらゆる情報を表にまとめました。これらのマーカーは、日本晴(ジャポニカ種)とKasalath(インディカ種)間の多型検出のために開発されました。これらのマーカーによる多型検出は、品種または系統の組合せに依存しますが、他の組合せでの分析に利用することができます。
このアーカイブは下記の最終更新日のデータを元に作成されており、現状とは必ずしも一致しない場合があります。
info データベースの利用許諾 CC 表示-継承
詳細
info 予算的背景・プロジェクト
名称:
第2期イネゲノム解析研究プロジェクト(平成10〜16年)
生命科学系主要プロジェクト一覧へのリンク
データベースのオリジナルサイト情報
info オリジナルサイト (公開停止中)http://rgp.dna.affrc.go.jp/E/publicdata/caps/index.html
info 運用開始年月日 2002年02月10日
info 最終更新年月日 2002年02月10日
info データの一括ダウンロードサイト -
info 参照先データベース -
info 一覧表示 有り
info クエリ検索 無し
info Webサービス 無し
info WebサービスURL -
info ユーザ登録 無し