データ説明 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| info データ名 | クローン一覧 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| info DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00147-001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| info データ内容の説明 | メダカcDNAクローンの3'及び5'末端配列の情報と各組織/発生段階別ライブラリごとに作成したクラスター (Tissue cluster)及び全ライブラリを対象としたクラスター (Merge cluster)の情報。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| info データファイル | データファイル名: medaka_full_length_cdna_clone.zip ファイルサイズ: 99MB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| info 簡易検索URL | http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/medaka_full_length_cdna_clone | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| info データ取得方法 | ABI3730XLを用いたサンガーシーケンス法により配列を取得 (Phrap法によるQuality check Phredスコア >30)し、FASTAによるクラスタリングを行っている。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| info 解析方法 | NCBI proteinのnon-redundant protein sequencesに対するblastx(version 2.2.15)でトップヒットを採用。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| info データ件数 | 257,122件 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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