コンティグ

生命科学系データベースアーカイブ

MAGEST

info データ名

コンティグ

info DOI

info データ内容の説明

マボヤESTをアセンブルして得られたコンセンサス配列のアノテーションや配列情報。11,299件。

info データファイル

データファイル名:

magest_contig.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

5.37MB

info 簡易検索URL

info データ取得方法

EGassembler

info 解析方法

info データ件数

11,299件

項目名	主キー	外部キー	項目の説明
Contig ID	コンティグのID
EST ID	このコンティグを構成するESTのID群。TogoDB版では、ESTのID群のテーブルへのリンク
Swiss-Prot	Swiss-Protに対するblastxによる相同性検索のトップヒット
Swiss-Prot ID	上記のエントリのアクセッション番号。TogoDB版では、UniProtへのリンク
KEGG GENES	KEGG GENESに対する相同性検索のトップヒット
KEGG GENES ID	KEGG GENESに対する相同性検索のトップヒットのID。TogoDB版では、KEGG GENESへのリンク
Ciona	JGI-Cionaに対する相同性検索のトップヒット
Ciona ID	JGI-Cionaに対する相同性検索のトップヒットのID。TogoDB版では、JGIへのリンク。
KEGG Orthology	関連するKEGG OrthologyのEntryとName
KEGG Orthology ID	関連するKEGG OrthologyのEntry。TogoDB版では、KEGG Orhologyのリンク
NT sequence	コンセンサス塩基配列
Length of NT sequence	塩基配列の長さ
AA sequence	コンセンサス塩基配列から翻訳されたアミノ酸配列
Length of AA sequence	アミノ酸配列の長さ

このデータベースについて