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生命科学系データベースアーカイブ

JSNP

データベースの説明

データベース全般

info 名称の読み方 ジェイスニップ
info 別名 Japanese Single Nucleotide Polymorphisms
info 作成者
作成者氏名:
東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター
作成者英名:
Human Genome Center, the Institute of Medical Science, the University of Tokyo
作成者所属:
作成者氏名:
国立研究開発法人 科学技術振興機構
作成者英名:
Japan Science and Technology Agency
作成者所属:
info データベース分類 ヒト遺伝子/疾患-多型データベース全般
info 生物種
生物種名:
Homo sapiens
Taxonomy ID:
info データベースの説明

日本人の持つ約19万7000の多型データにアノテーション(遺伝子情報、位置情報、アミノ酸置換情報等)を付加して公開しているデータベース

info データベースの特長・有用性・活用方法

日本人集団における遺伝子多型頻度の取得が可能

info データベースの利用許諾 CC 表示-継承 詳細
info 予算的背景・プロジェクト
名称:
ミレニアム・プロジェクト 「標準SNPs解析」 新エネルギー・産業技術総合開発機構(NEDO)
info 論文等
文献名:
JSNP: a database of common gene variations in the Japanese population
著者名:
Hirakawa M, Tanaka T, Hashimoto Y, Kuroda M, Takagi T, Nakamura Y.
雑誌名/掲載年月/号:
Nucleic Acids Research, 30:158-162, 2002
文献名:
Gene-based SNP discovery as part of the Japanese Millennium Genome Project : identification of 190,562 genetic variations in the human genome.
著者名:
Haga H, Yamada R, Ohnishi Y, Nakamura Y, Tanaka T.
雑誌名/掲載年月/号:
Journal of Human Genetics, 2002;47(11):605-610

データベースのオリジナルサイト情報

info データベース運用場所

(注記)オリジナルサイトでの公開を終了

info オリジナルサイト (運用終了) http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/index.html
お知らせページ:
info 最終更新年月日 2014年05月08日
info 統括サイト -
info データの一括ダウンロードサイト (運用終了) http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/data_download.html
info 参照先データベース

dbSNP

info 一覧表示 有り
info クエリ検索 有り
info Webサービス 無し
info WebサービスURL -
info ユーザ登録 無し

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