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生命科学系データベースアーカイブ

HHDB

分子情報

データ説明

info データ名 分子情報
info バージョン info データ内容の説明

2012年までに登録されたPDBエントリから、水素を含む構造(中性子回折による構造と、分解能1.0Å以下のX線回折による構造)を自動選択し、情報を自動抽出。

info データファイル
データファイル名:
hhdb_biomolecule.zip
ファイルサイズ:
9KB
info 簡易検索URL info データ取得方法

PDB (Protein Data Bank)

info 解析方法

登録されたPDBエントリから、水素を含む構造(中性子回折による構造と、分解能1.0Å以下のX線回折による構造)を自動選択し、情報を自動抽出

info データ件数

97

データ詳細

項目名項目の説明
Molecule No. 分子番号(オリジナルDBとアーカイブでは異なるものがあるので注意)
Molecule Name 分子名称
Molecule Classification PROTEIN, DNA等の分類
Wild/Mutant 野生型・変異型の別
PDB ID データ処理対象分子のPDB ID
Resolution 分解能(Å)
Lattice Constant A 格子定数(a)
Lattice Constant B 格子定数(b)
Lattice Constant C 格子定数(c)
Lattice Constant alpha 格子定数(alpha)
Lattice Constant beta 格子定数(beta)
Lattice Constant gamma 格子定数(gamma)
Space Group 空間群
Z value Z値
Experimental Method 実験手法 (NEUTRON: 中性子回折、X-RAY: X線回折)
Authors 著者(コンマ区切り)
Deposited PDBに登録された日
Released PDBで公開された日
Access Code アクセスコード
Registration HHDBに登録された日時
No Hydrogen 水素原子なしの場合はTRUE(t)
Hbonds 水素結合の数
HBondsSym 対称分子に対する水素結合の数
Atoms 原子数
H Atoms 水素原子の数
Waters 水分子の数

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