データ説明 |
| info データ名 | ORF配列情報 |
| info DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00077-007 |
| info データ内容の説明 | 本データベースに収録したORF及びその上流・下流の配列等 |
| info データファイル |
データファイル名: genobase_v6_seq.zip
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| info 簡易検索URL | http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_seq |
| info データ取得方法 | - |
| info 解析方法 | - |
| info データ件数 | 4,550件 |
データ詳細 |
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|
| Gene ID |
遺伝子のID |
| Left Point |
ORFのゲノム上の開始位置 |
| Right Point |
ORFのゲノム上の終了位置 |
| Direction |
ORFの向き(5'->3'なら1、3'->5'なら-1、不明なら0) |
| Map min |
ゲノム長を100とした場合の、このORFの位置 |
| NT Seq Length |
ORF配列長 |
| AA Seq Length |
ORF配列を翻訳したアミノ酸配列長 |
| Start Codon |
開始コドン |
| Stop Codon |
終止コドン |
| Upstream Sequence |
ORFの上流500bpの配列 |
| Sequence |
ORF配列 |
| Amino Acid Sequence |
ORF配列を翻訳したアミノ酸配列 |
| Downstream Sequence |
ORFの下流200bpの配列 |
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