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生命科学系データベースアーカイブ

GenoBase ver.6

遺伝子情報

データ説明

info データ名 遺伝子情報
info DOI
info データ内容の説明

大腸菌Escherichia coliのORF及び遺伝子の情報

info データファイル
データファイル名:
genobase_gene.zip
ファイルサイズ:
334KB
info 簡易検索URL
info データ取得方法

-

info 解析方法

-

info データ件数

5,626件

データ詳細

項目名項目の説明
Gene ID 遺伝子のID
Key 配列の種類("orf", "rna","rep_origin"のいずれか)
Gene Name 遺伝子の名前
Synonym 遺伝子名のシノニム
Left Point ORFのゲノム上の開始位置
Right Point ORFのゲノム上の終了位置
Direction ORFの向き(5'->3'なら1、3'->5'なら-1、不明なら0)
Function 遺伝子の機能(現在は利用されていない)
Description 遺伝子の説明
Comment この遺伝子に対するコメント
Reference この遺伝子について記載された文献
Old JW 以前のバージョンのGenoBaseにおけるGene ID
Sharp ID 遺伝子のID(Gene IDとは別の体系)
Old ID 以前に割り当てられていたSharp ID
MG1655 ID この遺伝子情報を得るためにシーケンスされたMG1655クローンのID
Swissprot この遺伝子に関連するSwissprotのID(現在は利用されていない)
E value この遺伝子配列と他の配列との間の相同性の期待値
EC ID この遺伝子に関連する酵素番号
EG ID この遺伝子に関連するEcoGeneのID
PEC ID この遺伝子に関連するProfiling of E.coli ChoromosomeのID
New JW 現在のバージョンのGenoBaseにおけるGene ID(現在使用されていないエントリに付与されている)
Accession 遺伝子に関連するUniprotエントリのID
ECK No このエントリに対応するEscherichia coli K-12株上の遺伝子番号、ECK-COG情報にリンク
Locus 遺伝子座の名前
History このエントリの変更履歴
Comment2 この遺伝子に対するコメント
Literature この遺伝子に関する文献のPubmed ID
Status このエントリの状態(最新であれば"current"、古いものであればどのバージョンで変更されたかが記載されている)

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