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生命科学系データベースアーカイブ

GenoBase ver.6

info データ名

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info DOI

info データ内容の説明

ORFと遺伝子の情報を中心に、クローンや配列情報へのリンクを表示したテーブル。GenoBaseデータの全体像を俯瞰することができる。

info データファイル

データファイル名:

genobase_main.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

159KB

info 簡易検索URL

info データ取得方法

info 解析方法

info データ件数

5,626件

項目名	項目の説明
Gene ID	遺伝子のID
Gene Name	遺伝子の名前
Synonym	遺伝子名のシノニム
Left Point	ORFのゲノム上の開始位置
Right Point	ORFのゲノム上の終了位置
Direction	ORFの向き(5'->3'なら1、3'->5'なら-1、不明なら0)
Description	遺伝子の説明
Old JW	以前のバージョンのGenoBaseにおけるGene ID
MG1655 ID	この遺伝子情報を得るためにシーケンスされたMG1655クローンのID
New JW	現在のバージョンのGenoBaseにおけるGene ID(現在使用されていないエントリに付与されている)
Accession	遺伝子に関連するUniprotエントリのID
ECK No	このエントリに対応するEscherichia coli K-12株上の遺伝子番号、ECK-COG情報にリンク
Status	このエントリの状態(最新であれば"current"、古いものであればどのバージョンで変更されたかが記載されている)
ASKA Clone	この遺伝子についてPPI実験を行ったASKA Cloneの情報にリンク
DEL Clone	この遺伝子の欠失株であるKeio Collectionの情報にリンク
Reference	この遺伝子について記載された文献番号(文献情報にリンク)
Sequence	このORFの配列情報にリンク

このデータベースについて