データ説明 | |||||||||||||||
| info データ名 | 配列データ | ||||||||||||||
| info DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00042-002 | ||||||||||||||
| info データ内容の説明 | 複数の個人(ほとんどの場合、8人)で標的配列(STS)をPCR増幅し、シーケンスすることによって同定されたSNPおよび周辺配列 | ||||||||||||||
| info データファイル | データファイル名: dbqsnp_fasta.zip ファイルサイズ: 1.0 MB | ||||||||||||||
| info 簡易検索URL | http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dbqsnp_fasta | ||||||||||||||
| info データ取得方法 | 個人のDNAをPCR増幅しサンガー法でシークエンス解析を行った。SNP配列は、Phred/Phrap/Polyphredソフトウエア(http://www.phrap.org/; http://droog.gs.washington.edu/polyphred/) を用いて検出し、目視により確認した。挿入・欠失変異は我々が独自開発したソフトウエアにより行った(三浦ら、特許第4009481号)。 | ||||||||||||||
| info 解析方法 | ここで解析したSNPは順次NCBIのdbSNPに登録した(ハンドル名:KYUGEN)。 | ||||||||||||||
| info データ件数 | 10,848 件 | ||||||||||||||
データ詳細 | |||||||||||||||
| |||||||||||||||