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生命科学系データベースアーカイブ

AcEST

AcEST

データ説明

info データ名 AcEST
info DOI
info データ内容の説明

ホウライシダEST(Adiantum capillus-veneris)配列とそのアノテーション(Clone ID、ライブラリ名、Blastx検索結果等)。CSV 形式テキストファイル。

info データファイル
データファイル名:
acest_est.zip
ファイルサイズ:
110MB
info 簡易検索URL
info データ取得方法

キャピラリーシーケンサー

info 解析方法

機能アノテーション(UniProtKB/Swiss-Prot 、及びUniProtKB/TrEMBLデータベースとの間のblastx検索結果)

info データ件数

30,540件

データ詳細

項目名項目の説明
Clone id ホウライシダEST(Adiantum capillus-veneris)配列のクローンID
Library ライブラリ名
Length 塩基数
Definition 定義
Accession DDBJ アクセッション番号
Tissue type 配列の得られた組織の名称
Developmental stage 発生段階
Sequence(60) 塩基配列(60文字で改行したもの)
sequence 塩基配列(改行なし)
しかくしかくHomology search results しかくしかく
Swiss-Prot (release 56.9) Swiss-Prot (release 56.9)とのblastx検索の結果
UniProt ID of top hit in Swiss-Prot Swiss-Prot (release 56.9)とのblastx検索で、最高スコアでヒットした配列のUniProt ID
Definition Swiss-Prot (release 56.9)とのblastx検索で、最高スコアでヒットした配列のAccessionとDefinition。TogoDBでは、Uniprotへのリン ク。
Align length Swiss-Prot (release 56.9)とのblastx検索で、最高スコアでヒットした配列との間のアラインメント長
Score (bit) Swiss-Prot (release 56.9)とのblastx検索で、最高スコアでヒットした配列との間のアラインメントのScore (bit)
E-value Swiss-Prot (release 56.9)とのblastx検索で、最高スコアでヒットした配列との間のアラインメントのE-value
Report UniProtKB/Swiss-Prot(release 56.9) データベースとのblastx検索結果
TrEMBL (release 39.9) TrEMBL (release 39.9)とのblastx検索の結果
UniProt ID of top hit in TrEMBL TrEMBL (release 39.9)とのblastx検索で最高スコアでヒットした配列のUniProt ID
Definition TrEMBL (release 39.9)とのblastx検索で最高スコアでヒットした配列のAccessionとDefinition。TogoDBでは、Uniprotへのリン ク。
Align length TrEMBL (release 39.9)とのblastx検索で、最高スコアでヒットした配列との間のアラインメント長
Score (bit) TrEMBL (release 39.9)とのblastx検索で、最高スコアでヒットした配列との間のアラインメントのScore (bit)
E-value TrEMBL (release 39.9)とのblastx検索で、最高スコアでヒットした配列との間のアラインメントのE-value
Report UniProtKB/TrEMBL (release 39.9) データベースとのblastx検索結果

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