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Gendoo







Gendoo

Gene, Disease Features Ontology-based Overview System

Ver. 2.206 ('12-04-06)

Gendoo provides keywords including diseases, drugs and biological phenomena related to genes and diseases of interests.



Gene → ...

Gene → Candidate → Related diseases, drugs, ...

Gene ID(s)/Gene Names:


Species:



Disease (OMIM) → ...

Disease (OMIM) → Candidate → Related drugs, tissues, biological phenomena (MeSH), ...

OMIM ID(s)/Disease Names (OMIM title):


- Old version is also available.



Keywords (MeSH) → ...

MeSH (keywords of diseases, drugs, and so on) → Candidate → Related genes, diseases (OMIM)

Keyword (MeSH term):

Species:



Help

Examples

  • Example 1: Diseases and drugs related to APP (amyloid precursor protein) [Gene ID: 351]
  • Example 2: Difference and similarity between type 1 and type 2 diabetes [OMIM ID: 222100, 125853]

News, Announcements, Discussion, ...

  • Gendoo Reports: The blog of Gendoo
  • Ver. 2.206 ('12-04-06): The 2012 version of allelic and non-allelic heterogeneity data are available.
  • Ver. 2.205 ('11-01-26): The 2011 version of allelic and non-allelic heterogeneity data are available.
  • Ver. 2.204 ('10-03-09): Japanese disease terms become acceptable.
  • Ver. 2.203 ('10-02-26): The 2010 version of allelic and non-allelic heterogeneity data are available.
  • Ver. 2.202 ('10-02-08): "Check All" button is added to candidate genes/diseases lists.
  • Ver. 2.201 ('09-09-17): Japanese translations of MeSH terms are added to MeSH tree.

Association data

Further data

References

Nakazato, T., Takinaka, T., Mizuguchi, H., Matsuda, H., Bono, H., and Asogawa, M.,
BioCompass: A novel functional inference tool that utilizes MeSH hierarchy to analyze groups of genes,
In Silico Biology, 8(1): 53-61, 2008. [PubMed] [Full Text]

Nakazato, T., Bono, H., Matsuda, H., and Takagi, T.,
Gendoo: Functional profiling of gene and disease features using MeSH vocabulary,
Nucleic Acids Research, 37(Suppl. 2) (Web Server Issue):W166-W169 2009. [PubMed] [Full Text]

Creative Commons License
この作品は、クリエイティブ・コモンズ・ライセンスの下でライセンスされています。
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 2.1 Japan License.

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