CRISPRdirect

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— Rational design of CRISPR/Cas target.

Enter an accession number (e.g. NM_006299) or genome location (e.g. hg19:chr7:900000-901000):

or Paste a nucleotide sequence:

or upload sequence file:

PAM sequence requirement: (e.g. NGG, NRG, NNGRRT, NG)

Specificity check:

Whats' new:
  • 2020年11月07日 Added mouse genome GRCm39/mm39.
  • 2020年09月11日 Longer/shorter PAM supported. (e.g. NNGRRT, NG)
  • 2018年05月07日 Added 12 genomes - List
  • 2017年12月11日 Added carrot genome v2.0 from Phytozome.
  • 2017年11月30日 Added 376 genomes from CyanoBase - List
  • 2017年11月08日 Added 5 species - List
  • 2017年06月19日 Added 8 species - List
  • 2017年06月09日 Added Human Japanese Reference Genome JRGv2.
  • 2017年02月17日 Brassica rapa genome v1.5 is available.
  • 2017年01月23日 Added 8 species - List
  • 2016年12月14日 CRISPRdirect shows restriction enzyme cutting sites - Sample
  • 2016年09月09日 Added 10 species - List
  • 2016年08月30日 Added Human Japanese Reference Genome JRGv1.
  • 2016年06月14日 Added 10 species - List
  • 2015年10月05日 CRISPRdirect supports 200+ species - List of species
  • 2015年01月13日 HTTPS encrypted connections supported - https://crispr.dbcls.jp/
  • 2014年11月21日 CRISPRdirect paper has been published in Bioinformatics - Full text
  • News archives

CRISPRdirect | DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).

If you use CRISPRdirect in your work, please cite:
Naito Y, Hino K, Bono H, Ui-Tei K. (2015)
CRISPRdirect: software for designing CRISPR/Cas guide RNA with reduced off-target sites.
Bioinformatics, 31, 1120-1123. [Full Text]

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