This directory contains a dump of the UCSC genome annotation database for the Jan. 2006 assembly of the opossum genome (UCSC version monDom4) from the Broad Institute at MIT and Harvard. The directory is updated nightly. The .txt.gz files contain the database tables in a tab-delimited format compressed with gzip. The .sql files contain the MySQL commands used to create the tables. To see descriptions of the tables underlying Genome Browser annotation tracks, select the table in the Table Browser: http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables?db=monDom4 and click the "describe table schema" button. There is also a "view table schema" link on the configuration page for each track. If you plan to download a large file or multiple files from this directory, we recommend that you use ftp rather than downloading the files via our website. To do so, ftp to hgdownload.cse.ucsc.edu, then go to the directory goldenPath/monDom4/database. To download multiple files, use the "mget" command: mget <filename1> <filename2> ... - or - mget -a (to download all the files in the directory) ----------------------------------------------------------- All the tables in this directory are freely usable for any purpose. The opossum sequence is made freely available before scientific publication with the following understanding: 1. The data may be freely downloaded, used in analyses, and repackaged in databases. 2. Users are free to use the data in scientific papers analyzing particular genes and regions if the providers of these data (The Broad Institute) are properly acknowledged. 3. The centers producing the data reserve the right to publish the initial large-scale analyses of the data set, including large-scale identification of regions of evolutionary conservation and large-scale genomic assembly. Large-scale refers to regions with size on the order of a chromosome (that is, 30 Mb or more). 4. Any redistribution of the data should carry this notice.
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Parent Directory - all_est.sql 2016年05月15日 10:43 2.1K all_est.txt.gz 2016年05月15日 10:43 16K all_mrna.sql 2019年03月17日 11:25 2.1K all_mrna.txt.gz 2019年03月17日 11:25 62K augustusGene.sql 2015年07月26日 16:38 1.9K augustusGene.txt.gz 2015年07月26日 16:38 2.0M bigFiles.sql 2025年10月12日 03:59 1.4K bigFiles.txt.gz 2025年10月12日 03:59 33 blastHg18KG.sql 2006年08月08日 12:23 2.1K blastHg18KG.txt.gz 2006年08月08日 12:23 3.6M chr1_chainCalJac1.sql 2008年04月24日 03:42 1.7K chr1_chainCalJac1.txt.gz 2008年04月24日 03:44 60M chr1_chainCalJac1Link.sql 2008年04月24日 03:45 1.4K chr1_chainCalJac1Link.txt.gz 2008年04月24日 03:51 207M chr1_chainCavPor3.sql 2008年06月13日 06:00 1.7K chr1_chainCavPor3.txt.gz 2008年06月13日 06:01 57M chr1_chainCavPor3Link.sql 2008年06月13日 06:03 1.4K chr1_chainCavPor3Link.txt.gz 2008年06月13日 06:11 274M chr1_chainDanRer4.sql 2006年08月08日 12:23 1.6K chr1_chainDanRer4.txt.gz 2006年08月08日 12:23 3.0M chr1_chainDanRer4Link.sql 2006年08月08日 12:23 1.4K chr1_chainDanRer4Link.txt.gz 2006年08月08日 12:23 16M 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