データ説明 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
info データ名 | TMFunctionデータ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
info DOI | 10.18908/lsdba.nbdc00714-001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
info データ内容の説明 | TMFunctionは、α-ヘリックス及びβ-バレル型膜タンパク質に含まれる機能的残基のデータベースです。各タンパク質の名称と由来はUniProtで同定していますが、PDBとも関連づけられるものは、そのIDを示しています。このデータベースには様々な実験手法やパラメータ(例えば、"affinity", "dissociation constant", "IC50", "activity"など)が含まれています。また、タンパク質中の各残基(またはその変異)には、計算または実験によって得られた数値が付与されています。このデータベースで用いた実験データは、ジャーナルの調査及びPubMedのキーワード検索によって得られた文献から収集したものです。さらに完全な参照情報(ジャーナルの引用とPubMed ID)も、このデータベースには含まれています。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
info データファイル | データファイル名: tmfunction.zip ファイルサイズ: 48.5 KB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
info 簡易検索URL | http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/tmfunction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
info データ取得方法 | UniProt, PDB, PubMed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
info 解析方法 | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
info データ件数 | 2,907 件 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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